TRPV6

TRPV6 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 765 амінокислот, а молекулярна маса — 87 286.

TRPV6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RFA
Ідентифікатори
Символи	TRPV6, ABP/ZF, CAT1, CATL, ECAC2, HSA277909, LP6728, ZFAB, transient receptor potential cation channel subfamily V member 6, HRPTTN
Зовнішні ІД	OMIM: 606680 MGI: 1927259 HomoloGene: 56812 GeneCards: TRPV6
Пов'язані генетичні захворювання
transient neonatal hyperparathyroidism
Реагує на сполуку
2-aminoethoxydiphenylborate
Онтологія гена Молекулярна функція • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • calcium channel activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • ion transport • calcium ion transport • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • response to calcium ion • calcium ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • calcium ion homeostasis • calcium ion import across plasma membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55503	64177
Ensembl	ENSG00000276971 ENSG00000165125	ENSMUSG00000029868
UniProt	Q9H1D0	Q91WD2
RefSeq (мРНК)	NM_018646 NM_014274	NM_022413
RefSeq (білок)	NP_061116	NP_071858
Локус (UCSC)	Хр. 7: 142.87 – 142.89 Mb	Хр. 6: 41.6 – 41.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPLQGDGGP		ALGGADVAPR		LSPVRVWPRP		QAPKEPALHP		MGLSLPKEKG
LILCLWSKFC		RWFQRRESWA		QSRDEQNLLQ		QKRIWESPLL		LAAKDNDVQA
LNKLLKYEDC		KVHQRGAMGE		TALHIAALYD		NLEAAMVLME		AAPELVFEPM
TSELYEGQTA		LHIAVVNQNM		NLVRALLARR		ASVSARATGT		AFRRSPCNLI
YFGEHPLSFA		ACVNSEEIVR		LLIEHGADIR		AQDSLGNTVL		HILILQPNKT
FACQMYNLLL		SYDRHGDHLQ		PLDLVPNHQG		LTPFKLAGVE		GNTVMFQHLM
QKRKHTQWTY		GPLTSTLYDL		TEIDSSGDEQ		SLLELIITTK		KREARQILDQ
TPVKELVSLK		WKRYGRPYFC		MLGAIYLLYI		ICFTMCCIYR		PLKPRTNNRT
SPRDNTLLQQ		KLLQEAYMTP		KDDIRLVGEL		VTVIGAIIIL		LVEVPDIFRM
GVTRFFGQTI		LGGPFHVLII		TYAFMVLVTM		VMRLISASGE		VVPMSFALVL
GWCNVMYFAR		GFQMLGPFTI		MIQKMIFGDL		MRFCWLMAVV		ILGFASAFYI
IFQTEDPEEL		GHFYDYPMAL		FSTFELFLTI		IDGPANYNVD		LPFMYSITYA
AFAIIATLLM		LNLLIAMMGD		THWRVAHERD		ELWRAQIVAT		TVMLERKLPR
CLWPRSGICG		REYGLGDRWF		LRVEDRQDLN		RQRIQRYAQA		FHTRGSEDLD
KDSVEKLELG		CPFSPHLSLP		MPSVSRSTSR		SSANWERLRQ		GTLRRDLRGI
INRGLEDGES		WEYQI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wood R.J., Tchack L., Taparia S. (2001). 1,25-dihydroxyvitamin D3 increases the expression of the CaT1 epithelial calcium channel in the Caco-2 human intestinal cell line. BMC Physiol. 1: 11—11. PMID 11545681 DOI:10.1186/1472-6793-1-11
• Peng J.-B., Brown E.M., Hediger M.A. (2001). Structural conservation of the genes encoding CaT1, CaT2, and related cation channels. Genomics. 76: 99—109. PMID 11549322 DOI:10.1006/geno.2001.6606
• Niemeyer B.A., Bergs C., Wissenbach U., Flockerzi V., Trost C. (2001). Competitive regulation of CaT-like-mediated Ca2+ entry by protein kinase C and calmodulin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 3600—3605. PMID 11248124 DOI:10.1073/pnas.051511398
• Bodding M., Flockerzi V. (2004). Ca2+ dependence of the Ca2+-selective TRPV6 channel. J. Biol. Chem. 279: 36546—36552. PMID 15184369 DOI:10.1074/jbc.M404679200

Див. також

• Хромосома 7