TRAF6

TRAF6 (англ. TNF receptor associated factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 59 573.

TRAF6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1LB4, 1LB5, 1LB6, 2ECI, 2JMD, 3HCS, 3HCT, 3HCU, 4Z8M
Ідентифікатори
Символи	TRAF6, MGC:3310, RNF85, TNF receptor associated factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 602355 MGI: 108072 HomoloGene: 3395 GeneCards: TRAF6
Онтологія гена Молекулярна функція • protein N-terminus binding • histone deacetylase binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thioesterase binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • protein kinase binding • protein kinase B binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • identical protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • tumor necrosis factor receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • lipid droplet • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic side of plasma membrane • клітинне ядро • клітинна мембрана • cell cortex • endosome membrane • CD40 receptor complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • response to interleukin-1 • toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • odontogenesis of dentin-containing tooth • animal organ morphogenesis • T-helper 1 type immune response • toll-like receptor 9 signaling pathway • regulation of apoptotic process • осифікація • cytokine-mediated signaling pathway • osteoclast differentiation • positive regulation of osteoclast differentiation • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • кісткова резорбція • JNK cascade • membrane protein intracellular domain proteolysis • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of T cell proliferation • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • protein autoubiquitination • процес імунної системи • positive regulation of JUN kinase activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-2 production • positive regulation of T cell cytokine production • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • розвиток клітин • protein K63-linked ubiquitination • myeloid dendritic cell differentiation • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • neural tube closure • bone remodeling • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • cellular response to lipopolysaccharide • T cell receptor signaling pathway • activation of protein kinase activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • interleukin-1-mediated signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7189	22034
Ensembl	ENSG00000175104	ENSMUSG00000027164
UniProt	Q9Y4K3	P70196
RefSeq (мРНК)	NM_145803 NM_004620	NM_009424 NM_001303273
RefSeq (білок)	NP_004611 NP_665802	NP_001290202 NP_033450
Локус (UCSC)	Хр. 11: 36.48 – 36.51 Mb	Хр. 2: 101.51 – 101.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLLNCENSC		GSSQSESDCC		VAMASSCSAV		TKDDSVGGTA		STGNLSSSFM
EEIQGYDVEF		DPPLESKYEC		PICLMALREA		VQTPCGHRFC		KACIIKSIRD
AGHKCPVDNE		ILLENQLFPD		NFAKREILSL		MVKCPNEGCL		HKMELRHLED
HQAHCEFALM		DCPQCQRPFQ		KFHINIHILK		DCPRRQVSCD		NCAASMAFED
KEIHDQNCPL		ANVICEYCNT		ILIREQMPNH		YDLDCPTAPI		PCTFSTFGCH
EKMQRNHLAR		HLQENTQSHM		RMLAQAVHSL		SVIPDSGYIS		EVRNFQETIH
QLEGRLVRQD		HQIRELTAKM		ETQSMYVSEL		KRTIRTLEDK		VAEIEAQQCN
GIYIWKIGNF		GMHLKCQEEE		KPVVIHSPGF		YTGKPGYKLC		MRLHLQLPTA
QRCANYISLF		VHTMQGEYDS		HLPWPFQGTI		RLTILDQSEA		PVRQNHEEIM
DAKPELLAFQ		RPTIPRNPKG		FGYVTFMHLE		ALRQRTFIKD		DTLLVRCEVS
TRFDMGSLRR		EGFQPRSTDA		GV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, пошкодження ДНК, убіквітинування білків, остеогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ліпідних краплях.

Література

• Cao Z., Xiong J., Takeuchi M., Kurama T., Goeddel D.V. (1996). TRAF6 is a signal transducer for interleukin-1. Nature. 383: 443—446. PMID 8837778 DOI:10.1038/383443a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Malinin N.L., Boldin M.P., Kovalenko A.V., Wallach D. (1997). MAP3K-related kinase involved in NF-kappaB induction by TNF, CD95 and IL-1. Nature. 385: 540—544. PMID 9020361 DOI:10.1038/385540a0
• Muzio M., Ni J., Feng P., Dixit V.M. (1997). IRAK (Pelle) family member IRAK-2 and MyD88 as proximal mediators of IL-1 signaling. Science. 278: 1612—1615. PMID 9374458 DOI:10.1126/science.278.5343.1612
• McCarthy J.V., Ni J., Dixit V.M. (1998). RIP2 is a novel NF-kappaB-activating and cell death-inducing kinase. J. Biol. Chem. 273: 16968—16975. PMID 9642260 DOI:10.1074/jbc.273.27.16968
• Khursigara G., Orlinick J.R., Chao M.V. (1999). Association of the p75 neurotrophin receptor with TRAF6. J. Biol. Chem. 274: 2597—2600. PMID 9915784 DOI:10.1074/jbc.274.5.2597

Див. також

• Хромосома 11