Синаптофізин

SYP
Ідентифікатори
Символи	SYP, MRX96, MRXsynaptophysin, XLID96
Зовнішні ІД	OMIM: 313475 MGI: 98467 HomoloGene: 2391 GeneCards: SYP
Пов'язані генетичні захворювання
	non-syndromic X-linked intellectual disability
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH2 domain binding; • protein self-association; • cholesterol binding; • identical protein binding; • syntaxin-1 binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • Синаптичні бульбашки; • синапс; • excitatory synapse; • synaptic vesicle membrane; • presynaptic active zone; • міжклітинні контакти; • terminal bouton; • integral component of synaptic vesicle membrane; • neuron projection; • neuron projection terminus; • presynaptic membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • neuromuscular junction; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • perinuclear region of cytoplasm;
Біологічний процес	• cellular response to organic substance; • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity; • ендоцитоз; • regulation of opioid receptor signaling pathway; • regulation of short-term neuronal synaptic plasticity; • synaptic vesicle membrane organization; • regulation of neuronal synaptic plasticity; • synaptic vesicle maturation; • synaptic vesicle endocytosis; • regulation of synaptic vesicle exocytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6855
	20977
	ENSG00000102003
	ENSMUSG00000031144
	P08247
	Q62277
	NM_003179
	NM_009305
	NP_003170
	NP_033331
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SYP (англ. Synaptophysin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 33 845^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLLADMDVV	NQLVAGGQFR	VVKEPLGFVK	VLQWVFAIFA	FATCGSYSGE
LQLSVDCANK	TESDLSIEVE	FEYPFRLHQV	YFDAPTCRGG	TTKVFLVGDY
SSSAEFFVTV	AVFAFLYSMG	ALATYIFLQN	KYRENNKGPM	LDFLATAVFA
FMWLVSSSAW	AKGLSDVKMA	TDPENIIKEM	PVCRQTGNTC	KELRDPVTSG
LNTSVVFGFL	NLVLWVGNLW	FVFKETGWAA	PFLRAPPGAP	EKQPAPGDAY
GDAGYGQGPG	GYGPQDSYGP	QGGYQPDYGQ	PAGSGGSGYG	PQGDYGQQGY
GPQGAPTSFS	NQM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література ред.

Suedhof T.C., Lottspeich F., Greengard P., Mehl E., Jahn R. (1987). The cDNA and derived amino acid sequences for rat and human synaptophysin. Nucleic Acids Res. 15: 9607—9607. PMID 3120152 DOI:10.1093/nar/15.22.9607
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504