SPO11

SPO11 (англ. SPO11, initiator of meiotic double stranded breaks) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 44 537.

SPO11
Ідентифікатори
Символи	SPO11, CT35, SPATA43, TOPVIA, initiator of meiotic double stranded breaks, SPO11 initiator of meiotic double stranded breaks, Meiotic recombination, Spo11, Meiotic_Spo11, IPR013048, Spo11, TOPOVIA
Зовнішні ІД	OMIM: 605114 MGI: 1349669 HomoloGene: 6059 GeneCards: SPO11
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • каталітична активність • hydrolase activity • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • isomerase activity • GO:0003918 DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity • endodeoxyribonuclease activity, producing 3'-phosphomonoesters • DNA binding Клітинна компонента • хромосома • теломера • клітинне ядро • nuclear chromosome Біологічний процес • protein localization to chromosome • female gamete generation • meiotic telomere clustering • male meiosis I • DNA metabolic process • DNA catabolic process, endonucleolytic • Оогенез • homologous chromosome pairing at meiosis • GO:0007126 мейоз • synaptonemal complex assembly • Сперматогенез • spermatid development • ovarian follicle development • meiotic DNA double-strand break processing • meiotic DNA double-strand break formation • reciprocal meiotic recombination • double-strand break repair involved in meiotic recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23626	26972
Ensembl	ENSG00000054796	ENSMUSG00000005883
UniProt	Q9Y5K1 Q5TCH6	Q9WTK8
RefSeq (мРНК)	NM_012444 NM_198265	NM_001083959 NM_001083960 NM_012046 NM_001305434
RefSeq (білок)	NP_036576 NP_937998	NP_001077428 NP_001077429 NP_001292363 NP_036176
Локус (UCSC)	Хр. 20: 57.33 – 57.34 Mb	Хр. 2: 172.82 – 172.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAFAPMGPEA		SFFDVLDRHR		ESLLAALRRG		GREPPTGGSR		LASSSEVLAS
IENIIQDIIT		SLARNEAPAF		TIDNRSSWEN		IKFEDSVGLQ		MVSHCTTRKI
KSDSPKSAQK		FSLILKILSM		IYKLVQSNTY		ATKRDIYYTD		SQLFGNQTVV
DNIINDISCM		LKVSRRSLHI		LSTSKGLIAG		NLRYIEEDGT		KVNCTCGATA
VAVPSNIQGI		RNLVTDAKFV		LIVEKDATFQ		RLLDDNFCNK		LSPCIMITGK
GVPDLNTRLL		VKKLWDTFHV		PVFTLVDADP		HGIEIMCIYK		YGSMSMSFEA
HHLTVPAIRW		LGLLPSDLKR		LNVPKDSLIP		LTKRDQMKLD		SILRRPYVTC
QPFWRKEMEI		MADSKMKAEI		QALTFLSSDY		LSRVYLPNKL		KFGGWI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• Shannon M., Richardson L., Christian A., Handel M.A., Thelen M.P. (1999). Differential gene expression of mammalian SPO11/TOP6A homologs during meiosis. FEBS Lett. 462: 329—334. PMID 10622720 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01546-X
• Romanienko P.J., Camerini-Otero R.D. (1999). Cloning, characterization, and localization of mouse and human SPO11. Genomics. 61: 156—169. PMID 10534401 DOI:10.1006/geno.1999.5955
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20