SP3

SP3 (англ. Sp3 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 81 925.

SP3
Ідентифікатори
Символи	SP3, SPR2, Sp3 transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 601804 MGI: 1277166 HomoloGene: 7952 GeneCards: SP3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • chromatin binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • PML body • transcription repressor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • protein-DNA complex Біологічний процес • megakaryocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • осифікація • lung development • embryonic placenta development • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • monocyte differentiation • protein sumoylation • transcription, DNA-templated • embryonic skeletal system development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • embryonic process involved in female pregnancy • T cell differentiation • granulocyte differentiation • embryonic camera-type eye morphogenesis • trophectodermal cell differentiation • enucleate erythrocyte differentiation • erythrocyte differentiation • definitive hemopoiesis • liver development • B cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • natural killer cell differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6670	20687
Ensembl	ENSG00000172845	ENSMUSG00000027109
UniProt	Q02447 Q86TP0	O70494
RefSeq (мРНК)	NM_003111 NM_001017371 NM_001172712	NM_001018042 NM_001098425 NM_011450
RefSeq (білок)	NP_001017371 NP_001166183 NP_003102 NP_003102.1	NP_001018052 NP_001091895
Локус (UCSC)	Хр. 2: 173.88 – 173.97 Mb	Хр. 2: 72.77 – 72.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTAPEKPVKQ		EEMAALDVDS		GGGGGGGGGH		GEYLQQQQQH		GNGAVAAAAA
AQDTQPSPLA		LLAATCSKIG		PPSPGDDEEE		AAAAAGAPAA		AGATGDLASA
QLGGAPNRWE		VLSATPTTIK		DEAGNLVQIP		SAATSSGQYV		LPLQNLQNQQ
IFSVAPGSDS		SNGTVSSVQY		QVIPQIQSAD		GQQVQIGFTG		SSDNGGINQE
SSQIQIIPGS		NQTLLASGTP		SANIQNLIPQ		TGQVQVQGVA		IGGSSFPGQT
QVVANVPLGL		PGNITFVPIN		SVDLDSLGLS		GSSQTMTAGI		NADGHLINTG
QAMDSSDNSE		RTGERVSPDI		NETNTDTDLF		VPTSSSSQLP		VTIDSTGILQ
QNTNSLTTSS		GQVHSSDLQG		NYIQSPVSEE		TQAQNIQVST		AQPVVQHLQL
QESQQPTSQA		QIVQGITPQT		IHGVQASGQN		ISQQALQNLQ		LQLNPGTFLI
QAQTVTPSGQ		VTWQTFQVQG		VQNLQNLQIQ		NTAAQQITLT		PVQTLTLGQV
AAGGAFTSTP		VSLSTGQLPN		LQTVTVNSID		SAGIQLHPGE		NADSPADIRI
KEEEPDPEEW		QLSGDSTLNT		NDLTHLRVQV		VDEEGDQQHQ		EGKRLRRVAC
TCPNCKEGGG		RGTNLGKKKQ		HICHIPGCGK		VYGKTSHLRA		HLRWHSGERP
FVCNWMYCGK		RFTRSDELQR		HRRTHTGEKK		FVCPECSKRF		MRSDHLAKHI
KTHQNKKGIH		SSSTVLASVE		AARDDTLITA		GGTTLILANI		QQGSVSGIGT
VNTSATSNQD		ILTNTEIPLQ		LVTVSGNETM		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hernandez E.M., Johnson A., Notario V., Chen A., Richert J.R. (2002). AUA as a translation initiation site in vitro for the human transcription factor Sp3. J. Biochem. Mol. Biol. 35: 273—282. PMID 12297010 DOI:10.5483/BMBRep.2002.35.3.273
• Moran K.M., Crusio R.H., Chan C.H., Grekova M.C., Richert J.R. (2004). Human transcription factor Sp3: genomic structure, identification of a processed pseudogene, and transcript analysis. Gene. 341: 235—247. PMID 15474306 DOI:10.1016/j.gene.2004.06.055
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Oleksiak M.F., Crawford D.L. (2002). 5' genomic structure of human Sp3. Mol. Biol. Evol. 19: 2026—2029. PMID 12411611 DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a004026
• Kingsley C., Winoto A. (1992). Cloning of GT box-binding proteins: a novel Sp1 multigene family regulating T-cell receptor gene expression. Mol. Cell. Biol. 12: 4251—4261. PMID 1341900 DOI:10.1128/MCB.12.10.4251
• Hagen G., Mueller S., Beato M., Suske G. (1992). Cloning by recognition site screening of two novel GT box binding proteins: a family of Sp1 related genes. Nucleic Acids Res. 20: 5519—5525. PMID 1454515 DOI:10.1093/nar/20.21.5519

Див. також

• Хромосома 2