SMC6

SMC6 (англ. Structural maintenance of chromosomes 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 091 амінокислот, а молекулярна маса — 126 326.

SMC6
Ідентифікатори
Символи	SMC6, SMC-6, SMC6L1, hstructural maintenance of chromosomes 6
Зовнішні ІД	OMIM: 609387 MGI: 1914491 HomoloGene: 41575 GeneCards: SMC6
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • site of double-strand break • PML body • Статеві хромосоми • nuclear speck • Smc5-Smc6 complex • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • хромосома • теломера • interchromatin granule • клітинне ядро Біологічний процес • DNA recombination • cellular response to DNA damage stimulus • telomere maintenance via recombination • клітинне старіння • positive regulation of chromosome segregation • double-strand break repair via homologous recombination • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79677	67241
Ensembl	ENSG00000163029	ENSMUSG00000020608
UniProt	Q96SB8	Q924W5
RefSeq (мРНК)	NM_001142286 NM_024624	NM_025695 NM_001324476 NM_001361252
RefSeq (білок)	NP_001135758 NP_078900	NP_001311405 NP_079971 NP_001348181
Локус (UCSC)	Хр. 2: 17.66 – 17.8 Mb	Хр. 12: 11.32 – 11.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKRKEENFS		SPKNAKRPRQ		EELEDFDKDG		DEDECKGTTL		TAAEVGIIES
IHLKNFMCHS		MLGPFKFGSN		VNFVVGNNGS		GKSAVLTALI		VGLGGRAVAT
NRGSSLKGFV		KDGQNSADIS		ITLRNRGDDA		FKASVYGNSI		LIQQHISIDG
SRSYKLKSAT		GSVVSTRKEE		LIAILDHFNI		QVDNPVSVLT		QEMSKQFLQS
KNEGDKYKFF		MKATQLEQMK		EDYSYIMETK		ERTKEQIHQG		EERLTELKRQ
CVEKEERFQS		IAGLSTMKTN		LESLKHEMAW		AVVNEIEKQL		NAIRDNIKIG
EDRAARLDRK		MEEQQVRLNE		AEQKYKDIQD		KLEKISEETN		ARAPECMALK
ADVVAKKRAY		NEAEVLYNRS		LNEYKALKKD		DEQLCKRIEE		LKKSTDQSLE
PERLERQKKI		SWLKERVKAF		QNQENSVNQE		IEQFQQAIEK		DKEEHGKIKR
EELDVKHALS		YNQRQLKELK		DSKTDRLKRF		GPNVPALLEA		IDDAYRQGHF
TYKPVGPLGA		CIHLRDPELA		LAIESCLKGL		LQAYCCHNHA		DERVLQALMK
RFYLPGTSRP		PIIVSEFRNE		IYDVRHRAAY		HPDFPTVLTA		LEIDNAVVAN
SLIDMRGIET		VLLIKNNSVA		RAVMQSQKPP		KNCREAFTAD		GDQVFAGRYY
SSENTRPKFL		SRDVDSEISD		LENEVENKTA		QILNLQQHLS		ALEKDIKHNE
ELLKRCQLHY		KELKMKIRKN		ISEIRELENI		EEHQSVDIAT		LEDEAQENKS
KMKMVEEHME		QQKENMEHLK		SLKIEAENKY		DAIKFKINQL		SELADPLKDE
LNLADSEVDN		QKRGKRHYEE		KQKEHLDTLN		KKKRELDMKE		KELEEKMSQA
RQICPERIEV		EKSASILDKE		INRLRQKIQA		EHASHGDREE		IMRQYQEARE
TYLDLDSKVR		TLKKFIKLLG		EIMEHRFKTY		QQFRRCLTLR		CKLYFDNLLS
QRAYCGKMNF		DHKNETLSIS		VQPGEGNKAA		FNDMRALSGG		ERSFSTVCFI
LSLWSIAESP		FRCLDEFDVY		MDMVNRRIAM		DLILKMADSQ		RFRQFILLTP
QSMSSLPSSK		LIRILRMSDP		ERGQTTLPFR		PVTQEEDDDQ		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Harvey S.H., Sheedy D.M., Cuddihy A.R., O'Connell M.J. (2004). Coordination of DNA damage responses via the Smc5/Smc6 complex. Mol. Cell. Biol. 24: 662—674. PMID 14701739 DOI:10.1128/MCB.24.2.662-674.2004
• Potts P.R., Yu H. (2005). Human MMS21/NSE2 is a SUMO ligase required for DNA repair. Mol. Cell. Biol. 25: 7021—7032. PMID 16055714 DOI:10.1128/MCB.25.16.7021-7032.2005
• Potts P.R., Porteus M.H., Yu H. (2006). Human SMC5/6 complex promotes sister chromatid homologous recombination by recruiting the SMC1/3 cohesin complex to double-strand breaks. EMBO J. 25: 3377—3388. PMID 16810316 DOI:10.1038/sj.emboj.7601218
• Potts P.R., Yu H. (2007). The SMC5/6 complex maintains telomere length in ALT cancer cells through SUMOylation of telomere-binding proteins. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 581—590. PMID 17589526 DOI:10.1038/nsmb1259
• Taylor E.M., Copsey A.C., Hudson J.J., Vidot S., Lehmann A.R. (2008). Identification of the proteins, including MAGEG1, that make up the human SMC5-6 protein complex. Mol. Cell. Biol. 28: 1197—1206. PMID 18086888 DOI:10.1128/MCB.00767-07

Див. також

• Хромосома 2