SMC1B
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SMC1B (англ. Structural maintenance of chromosomes 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 235 амінокислот, а молекулярна маса — 143 908[4].
| SMC1B | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | SMC1B, SMC1BETA, SMC1L2, structural maintenance of chromosomes 1B | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 608685 MGI: 2154049 HomoloGene: 13786 GeneCards: SMC1B | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
|
|||||||||||||||
| Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
| UniProt |
|
|
|||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 22: 45.34 – 45.41 Mb | Хр. 15: 84.95 – 85.02 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MAHLELLLVE | NFKSWRGRQV | IGPFRRFTCI | IGPNGSGKSN | VMDALSFVMG | ||||
| EKIANLRVKN | IQELIHGAHI | GKPISSSASV | KIIYVEESGE | EKTFARIIRG | ||||
| GCSEFRFNDN | LVSRSVYIAE | LEKIGIIVKA | QNCLVFQGTV | ESISVKKPKE | ||||
| RTQFFEEIST | SGELIGEYEE | KKRKLQKAEE | DAQFNFNKKK | NIAAERRQAK | ||||
| LEKEEAERYQ | SLLEELKMNK | IQLQLFQLYH | NEKKIHLLNT | KLEHVNRDLS | ||||
| VKRESLSHHE | NIVKARKKEH | GMLTRQLQQT | EKELKSVETL | LNQKRPQYIK | ||||
| AKENTSHHLK | KLDVAKKSIK | DSEKQCSKQE | DDIKALETEL | ADLDAAWRSF | ||||
| EKQIEEEILH | KKRDIELEAS | QLDRYKELKE | QVRKKVATMT | QQLEKLQWEQ | ||||
| KTDEERLAFE | KRRHGEVQGN | LKQIKEQIED | HKKRIEKLEE | YTKTCMDCLK | ||||
| EKKQQEETLV | DEIEKTKSRM | SEFNEELNLI | RSELQNAGID | THEGKRQQKR | ||||
| AEVLEHLKRL | YPDSVFGRLF | DLCHPIHKKY | QLAVTKVFGR | FITAIVVASE | ||||
| KVAKDCIRFL | KEERAEPETF | LALDYLDIKP | INERLRELKG | CKMVIDVIKT | ||||
| QFPQLKKVIQ | FVCGNGLVCE | TMEEARHIAL | SGPERQKTVA | LDGTLFLKSG | ||||
| VISGGSSDLK | YKARCWDEKE | LKNLRDRRSQ | KIQELKGLMK | TLRKETDLKQ | ||||
| IQTLIQGTQT | RLKYSQNELE | MIKKKHLVAF | YQEQSQLQSE | LLNIESQCIM | ||||
| LSEGIKERQR | RIKEFQEKID | KVEDDIFQHF | CEEIGVENIR | EFENKHVKRQ | ||||
| QEIDQKRYFY | KKMLTRLNVQ | LEYSRSHLKK | KLNKINTLKE | TIQKGSEDID | ||||
| HLKKAEENCL | QTVNELMAKQ | QQLKDIRVTQ | NSSAEKVQTQ | IEEERKKFLA | ||||
| VDREVGKLQK | EVVSIQTSLE | QKRLEKHNLL | LDCKVQDIEI | ILLSGSLDDI | ||||
| IEVEMGTEAE | STQATIDIYE | KEEAFEIDYS | SLKEDLKALQ | SDQEIEAHLR | ||||
| LLLQQVASQE | DILLKTAAPN | LRALENLKTV | RDKFQESTDA | FEASRKEARL | ||||
| CRQEFEQVKK | RRYDLFTQCF | EHVSISIDQI | YKKLCRNNSA | QAFLSPENPE | ||||
| EPYLEGISYN | CVAPGKRFMP | MDNLSGGEKC | VAALALLFAV | HSFRPAPFFV | ||||
| LDEVDAALDN | TNIGKVSSYI | KEQTQDQFQM | IVISLKEEFY | SRADALIGIY | ||||
| PEYDDCMFSR | VLTLDLSQYP | DTEGQESSKR | HGESR |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
Література
ред.- Cobbe N., Heck M.M.S. (2004). The evolution of SMC proteins: phylogenetic analysis and structural implications. Mol. Biol. Evol. 21: 332—347. PMID 14660695 DOI:10.1093/molbev/msh023
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11112 (англ.) . Архів оригіналу за 1 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NDV3 (англ.) . Архів оригіналу за 30 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
ред.
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |