SLFN11

SLFN11 (англ. Schlafen family member 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 901 амінокислот, а молекулярна маса — 102 836.

SLFN11
Ідентифікатори
Символи	SLFN11, SLFN8/9, schlafen family member 11
Зовнішні ІД	OMIM: 614953 MGI: 2672859 HomoloGene: 89175 GeneCards: SLFN11
Онтологія гена Молекулярна функція • tRNA binding • nucleotide binding • ATP binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATPase activity • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • aggresome • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • site of DNA damage • хромосома Біологічний процес • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • defense response to virus • процес імунної системи • negative regulation of DNA replication • positive regulation of cell death • replication fork arrest • cellular response to DNA damage stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91607	276950
Ensembl	ENSG00000172716	ENSMUSG00000035208
UniProt	Q7Z7L1	B1ARD8
RefSeq (мРНК)	NM_001104587 NM_001104588 NM_001104589 NM_001104590 NM_152270 NM_001376007 NM_001376008 NM_001376009 NM_001376010 NM_001376011 NM_001376012 NM_001387158 NM_001387159 NM_001387160 NM_001387161 NM_001387162 NM_001387163	NM_001167743 NM_181545
RefSeq (білок)	NP_001098057 NP_001098058 NP_001098059 NP_001098060 NP_689483 NP_001362936 NP_001362937 NP_001362938 NP_001362939 NP_001362940 NP_001362941	NP_001161215 NP_853523
Локус (UCSC)	Хр. 17: 35.35 – 35.37 Mb	Хр. 11: 82.89 – 82.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEANQCPLVV		EPSYPDLVIN		VGEVTLGEEN		RKKLQKIQRD		QEKERVMRAA
CALLNSGGGV		IRMAKKVEHP		VEMGLDLEQS		LRELIQSSDL		QAFFETKQQG
RCFYIFVKSW		SSGPFPEDRS		VKPRLCSLSS		SLYRRSETSV		RSMDSREAFC
FLKTKRKPKI		LEEGPFHKIH		KGVYQELPNS		DPADPNSDPA		DLIFQKDYLE
YGEILPFPES		QLVEFKQFST		KHFQEYVKRT		IPEYVPAFAN		TGGGYLFIGV
DDKSREVLGC		AKENVDPDSL		RRKIEQAIYK		LPCVHFCQPQ		RPITFTLKIV
NVLKRGELYG		YACMIRVNPF		CCAVFSEAPN		SWIVEDKYVC		SLTTEKWVGM
MTDTDPDLLQ		LSEDFECQLS		LSSGPPLSRP		VYSKKGLEHK		KELQQLLFSV
PPGYLRYTPE		SLWRDLISEH		RGLEELINKQ		MQPFFRGILI		FSRSWAVDLN
LQEKPGVICD		ALLIAQNSTP		ILYTILREQD		AEGQDYCTRT		AFTLKQKLVN
MGGYTGKVCV		RAKVLCLSPE		SSAEALEAAV		SPMDYPASYS		LAGTQHMEAL
LQSLVIVLLG		FRSLLSDQLG		CEVLNLLTAQ		QYEIFSRSLR		KNRELFVHGL
PGSGKTIMAM		KIMEKIRNVF		HCEAHRILYV		CENQPLRNFI		SDRNICRAET
RKTFLRENFE		HIQHIVIDEA		QNFRTEDGDW		YGKAKSITRR		AKGGPGILWI
FLDYFQTSHL		DCSGLPPLSD		QYPREELTRI		VRNADPIAKY		LQKEMQVIRS
NPSFNIPTGC		LEVFPEAEWS		QGVQGTLRIK		KYLTVEQIMT		CVADTCRRFF
DRGYSPKDVA		VLVSTAKEVE		HYKYELLKAM		RKKRVVQLSD		ACDMLGDHIV
LDSVRRFSGL		ERSIVFGIHP		RTADPAILPN		VLICLASRAK		QHLYIFPWGG
H

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК, тРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17