SRSF1

SRSF1 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 248 амінокислот, а молекулярна маса — 27 745.

SRSF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X4A, 2M7S, 2M8D, 2O3D, 3BEG, 4C0O
Ідентифікатори
Символи	SRSF1, ASF, SF2, SF2p33, SFRS1, SRp30a, ASF/SF2, serine/arginine-rich splicing factor 1, serine and arginine rich splicing factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600812 MGI: 98283 HomoloGene: 31411 GeneCards: SRSF1
Онтологія гена Молекулярна функція • RS domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • mRNA binding • protein kinase B binding • DNA topoisomerase binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • exon-exon junction complex • нуклеоплазма • spliceosomal complex • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA transport • cardiac muscle contraction • mRNA processing • in utero embryonic development • mRNA export from nucleus • mRNA splice site selection • mRNA 5'-splice site recognition • mRNA 3'-end processing • liver regeneration • Альтернативний сплайсинг • Сплайсинг РНК • oligodendrocyte differentiation • RNA export from nucleus • positive regulation of RNA splicing • GO:0015915 транспорт • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6426	110809
Ensembl	ENSG00000136450	ENSMUSG00000018379
UniProt	Q07955	Q6PDM2
RefSeq (мРНК)	NM_001078166 NM_006924	NM_001078167 NM_173374
RefSeq (білок)	NP_001071634 NP_008855	NP_001071635 NP_775550
Локус (UCSC)	Хр. 17: 58 – 58.01 Mb	Хр. 11: 87.94 – 87.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGGGVIRGP		AGNNDCRIYV		GNLPPDIRTK		DIEDVFYKYG		AIRDIDLKNR
RGGPPFAFVE		FEDPRDAEDA		VYGRDGYDYD		GYRLRVEFPR		SGRGTGRGGG
GGGGGGAPRG		RYGPPSRRSE		NRVVVSGLPP		SGSWQDLKDH		MREAGDVCYA
DVYRDGTGVV		EFVRKEDMTY		AVRKLDNTKF		RSHEGETAYI		RVKVDGPRSP
SYGRSRSRSR		SRSRSRSRSN		SRSRSYSPRR		SRGSPRYSPR		HSRSRSRT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Ge H., Zuo P., Manley J.L. (1991). Primary structure of the human splicing factor ASF reveals similarities with Drosophila regulators. Cell. 66: 373—382. PMID 1855257 DOI:10.1016/0092-8674(91)90626-A
• Krainer A.R., Mayeda A., Kozak D., Binns G. (1991). Functional expression of cloned human splicing factor SF2: homology to RNA-binding proteins, U1 70K, and Drosophila splicing regulators. Cell. 66: 383—394. PMID 1830244 DOI:10.1016/0092-8674(91)90627-B
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837
• Mayeda A., Zahler A.M., Krainer A.R., Roth M.B. (1992). Two members of a conserved family of nuclear phosphoproteins are involved in pre-mRNA splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1301—1304. PMID 1741384 DOI:10.1073/pnas.89.4.1301
• Wu J.Y., Maniatis T. (1993). Specific interactions between proteins implicated in splice site selection and regulated alternative splicing. Cell. 75: 1061—1070. PMID 8261509 DOI:10.1016/0092-8674(93)90316-I

Див. також

• Хромосома 17