SF3A1

SF3A1 (англ. Splicing factor 3a subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 88 886.

SF3A1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZKH, 2DT6, 2DT7
Ідентифікатори
Символи	SF3A1, PRP21, PRPF21, SAP114, SF3A120, splicing factor 3a subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605595 MGI: 1914715 HomoloGene: 4294 GeneCards: SF3A1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • U2-type spliceosomal complex • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck • U2 snRNP • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • U2-type prespliceosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10291	67465
Ensembl	ENSG00000099995	ENSMUSG00000002129
UniProt	Q15459	Q8K4Z5
RefSeq (мРНК)	NM_005877 NM_001005409	NM_026175
RefSeq (білок)	NP_005868	NP_080451
Локус (UCSC)	Хр. 22: 30.33 – 30.36 Mb	Хр. 11: 4.11 – 4.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAGPVQAVP		PPPPVPTEPK		QPTEEEASSK		EDSAPSKPVV		GIIYPPPEVR
NIVDKTASFV		ARNGPEFEAR		IRQNEINNPK		FNFLNPNDPY		HAYYRHKVSE
FKEGKAQEPS		AAIPKVMQQQ		QQTTQQQLPQ		KVQAQVIQET		IVPKEPPPEF
EFIADPPSIS		AFDLDVVKLT		AQFVARNGRQ		FLTQLMQKEQ		RNYQFDFLRP
QHSLFNYFTK		LVEQYTKILI		PPKGLFSKLK		KEAENPREVL		DQVCYRVEWA
KFQERERKKE		EEEKEKERVA		YAQIDWHDFV		VVETVDFQPN		EQGNFPPPTT
PEELGARILI		QERYEKFGES		EEVEMEVESD		EEDDKQEKAE		EPPSQLDQDT
QVQDMDEGSD		DEEEGQKVPP		PPETPMPPPL		PPTPDQVIVR		KDYDPKASKP
LPPAPAPDEY		LVSPITGEKI		PASKMQEHMR		IGLLDPRWLE		QRDRSIREKQ
SDDEVYAPGL		DIESSLKQLA		ERRTDIFGVE		ETAIGKKIGE		EEIQKPEEKV
TWDGHSGSMA		RTQQAAQANI		TLQEQIEAIH		KAKGLVPEDD		TKEKIGPSKP
NEIPQQPPPP		SSATNIPSSA		PPITSVPRPP		TMPPPVRTTV		VSAVPVMPRP
PMASVVRLPP		GSVIAPMPPI		IHAPRINVVP		MPPSAPPIMA		PRPPPMIVPT
AFVPAPPVAP		VPAPAPMPPV		HPPPPMEDEP		TSKKLKTEDS		LMPEEEFLRR
NKGPVSIKVQ		VPNMQDKTEW		KLNGQVLVFT		LPLTDQVSVI		KVKIHEATGM
PAGKQKLQYE		GIFIKDSNSL		AYYNMANGAV		IHLALKERGG		RKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Kraemer A., Mulhauser F., Wersig C., Groning K., Bilbe G. (1995). Mammalian splicing factor SF3a120 represents a new member of the SURP family of proteins and is homologous to the essential splicing factor PRP21p of Saccharomyces cerevisiae. RNA. 1: 260—272. PMID 7489498

Див. також

• Хромосома 22