S100A4

S100A4 (англ. S100 calcium binding protein A4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 101 амінокислот, а молекулярна маса — 11 729.

S100A4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1M31, 2LNK, 2MRD, 2Q91, 3C1V, 3CGA, 3KO0, 3M0W, 3ZWH, 4CFQ, 4CFR, 4ETO, 4HSZ
Ідентифікатори
Символи	S100A4, 18A2, 42A, CAPL, FSP1, MTS1, P9KA, PEL98, S100 calcium binding protein A4
Зовнішні ІД	OMIM: 114210 MGI: 1330282 HomoloGene: 7924 GeneCards: S100A4
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium-dependent protein binding • зв'язування з іоном металу • RAGE receptor binding • RNA binding • transition metal ion binding • identical protein binding Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • Епітеліально-мезенхімальний перехід Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6275	20198
Ensembl	ENSG00000196154	ENSMUSG00000001020
UniProt	P26447	P07091
RefSeq (мРНК)	NM_019554 NM_002961	NM_011311
RefSeq (білок)	NP_002952 NP_062427	NP_035441
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.54 – 153.55 Mb	Хр. 3: 90.51 – 90.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MACPLEKALD		VMVSTFHKYS		GKEGDKFKLN		KSELKELLTR		ELPSFLGKRT
DEAAFQKLMS		NLDSNRDNEV		DFQEYCVFLS		CIAMMCNEFF		EGFPDKQPRK
K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

• Engelkamp D., Schaefer B.W., Erne P., Heizmann C.W. (1992). S100 alpha, CAPL, and CACY: molecular cloning and expression analysis of three calcium-binding proteins from human heart. Biochemistry. 31: 10258—10264. PMID 1384693 DOI:10.1021/bi00157a012
• Engelkamp D., Schaefer B.W., Mattei M.-G., Erne P., Heizmann C.W. (1993). Six S100 genes are clustered on human chromosome 1q21: identification of two genes coding for the two previously unreported calcium-binding proteins S100D and S100E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 6547—6551. PMID 8341667 DOI:10.1073/pnas.90.14.6547
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tomida Y., Terasawa M., Kobayashi R., Hidaka H. (1992). Calcyclin and calvasculin exist in human platelets. Biochem. Biophys. Res. Commun. 189: 1310—1316. PMID 1482346 DOI:10.1016/0006-291X(92)90216-8

Див. також

• Хромосома 1