RPRD1A

RPRD1A (англ. Regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 312 амінокислот, а молекулярна маса — 35 720.

RPRD1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4JXT, 4NAC
Ідентифікатори
Символи	RPRD1A, HsT3101, P15RS, regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 610347 MGI: 2385066 HomoloGene: 124432 GeneCards: RPRD1A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • RNA polymerase II complex binding Клітинна компонента • RNA polymerase II, holoenzyme • нуклеоплазма Біологічний процес • dephosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • snRNA transcription by RNA polymerase II • mRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55197	225283
Ensembl	ENSG00000141425	ENSMUSG00000040446
UniProt	Q96P16	Q8VDS4
RefSeq (мРНК)	NM_001303411 NM_001303412 NM_001303413 NM_018170	NM_144861 NM_001360807
RefSeq (білок)	NP_001290340 NP_001290341 NP_001290342 NP_060640	NP_659110 NP_001347736
Локус (UCSC)	Хр. 18: 35.98 – 36.07 Mb	Хр. 18: 24.62 – 24.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAFSEAALE		KKLSELSNSQ		QSVQTLSLWL		IHHRKHSRPI		VTVWERELRK
AKPNRKLTFL		YLANDVIQNS		KRKGPEFTKD		FAPVIVEAFK		HVSSETDESC
KKHLGRVLSI		WEERSVYEND		VLEQLKQALY		GDKKPRKRTY		EQIKVDENEN
CSSLGSPSEP		PQTLDLVRAL		QDLENAASGD		AAVHQRIASL		PVEVQEVSLL
DKITDKESGE		RLSKMVEDAC		MLLADYNGRL		AAEIDDRKQL		TRMLADFLRC
QKEALAEKEH		KLEEYKRKLA		RVSLVRKELR		SRIQSLPDLS		RLPNVTGSHM
HLPFAGDIYS		ED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 18