RHBDL1

RHBDL1 (англ. Rhomboid like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 438 амінокислот, а молекулярна маса — 48 314.

RHBDL1
Ідентифікатори
Символи	RHBDL1, RHBDL, RRP, rhomboid like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603264 MGI: 2384891 HomoloGene: 2946 GeneCards: RHBDL1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • protein processing • GO:0072468 сигнальна трансдукція • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9028	214951
Ensembl	ENSG00000103269	ENSMUSG00000025735
UniProt	O75783	Q8VC82
RefSeq (мРНК)	NM_001278720 NM_001278721 NM_003961 NM_001318733	NM_144816
RefSeq (білок)	NP_001265649 NP_001265650 NP_001305662	NP_659065
Локус (UCSC)	Хр. 16: 0.68 – 0.68 Mb	Хр. 17: 26.05 – 26.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRVEDGGTT		EELEDWDPGT		SALPAPGIKQ		GPREQTGTGP		LSQKCWEPEP
DAPSQPGPAL		WSRGRARTQA		LAGGSSLQQL		DPENTGFIGA		DTFTGLVHSH
ELPLDPAKLD		MLVALAQSNE		QGQVCYQELV		DLISSKRSSS		FKRAIANGQR
ALPRDGPLDE		PGLGVYKRFV		RYVAYEILPC		EVDRRWYFYR		HRSCPPPVFM
ASVTLAQIIV		FLCYGARLNK		WVLQTYHPEY		MKSPLVYHPG		HRARAWRFLT
YMFMHVGLEQ		LGFNALLQLM		IGVPLEMVHG		LLRISLLYLA		GVLAGSLTVS
ITDMRAPVVG		GSGGVYALCS		AHLANVVMNW		AGMRCPYKLL		RMVLALVCMS
SEVGRAVWLR		FSPPLPASGP		QPSFMAHLAG		AVVGVSMGLT		ILRSYEERLR
DQCGWWVVLL		AYGTFLLFAV		FWNVFAYDLL		GAHIPPPP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Pascall J.C., Brown K.D. (1998). Characterization of a mammalian cDNA encoding a protein with high sequence similarity to the Drosophila regulatory protein Rhomboid. FEBS Lett. 429: 337—340. PMID 9662444 DOI:10.1016/S0014-5793(98)00622-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16