RHBDD1

RHBDD1 (англ. Rhomboid domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 315 амінокислот, а молекулярна маса — 35 823.

RHBDD1
Ідентифікатори
Символи	RHBDD1, RRP4, rhomboid domain containing 1, RHBDL4
Зовнішні ІД	OMIM: 617515 MGI: 1924117 HomoloGene: 12659 GeneCards: RHBDD1
Онтологія гена Молекулярна функція • endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum quality control compartment • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія Біологічний процес • диференціація клітин • ERAD pathway • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • membrane protein proteolysis • cellular response to UV • посттрансляційна модифікація • negative regulation of apoptotic process • протеоліз • membrane protein proteolysis involved in retrograde protein transport, ER to cytosol • spermatid differentiation • membrane protein intracellular domain proteolysis • positive regulation of secretion • positive regulation of protein processing • Сперматогенез • Unfolded Protein Response • regulation of male germ cell proliferation • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84236	76867
Ensembl	ENSG00000144468	ENSMUSG00000026142
UniProt	Q8TEB9	Q8BHC7
RefSeq (мРНК)	NM_001167608 NM_032276 NM_001349069 NM_001349071 NM_001349072	NM_001122685 NM_029777
RefSeq (білок)	NP_001161080 NP_115652 NP_001335998 NP_001336000 NP_001336001 NP_001161080.1 NP_115652.2	NP_001116157 NP_084053
Локус (UCSC)	Хр. 2: 226.84 – 227 Mb	Хр. 1: 82.29 – 82.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRRSRGINT		GLILLLSQIF		HVGINNIPPV		TLATLALNIW		FFLNPQKPLY
SSCLSVEKCY		QQKDWQRLLL		SPLHHADDWH		LYFNMASMLW		KGINLERRLG
SRWFAYVITA		FSVLTGVVYL		LLQFAVAEFM		DEPDFKRSCA		VGFSGVLFAL
KVLNNHYCPG		GFVNILGFPV		PNRFACWVEL		VAIHLFSPGT		SFAGHLAGIL
VGLMYTQGPL		KKIMEACAGG		FSSSVGYPGR		QYYFNSSGSS		GYQDYYPHGR
PDHYEEAPRN		YDTYTAGLSE		EEQLERALQA		SLWDRGNTRN		SPPPYGFHLS
PEEMRRQRLH		RFDSQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2