RBCK1

RBCK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CRC, 2LGY, 4DBG
Ідентифікатори
Символи	RBCK1, C20orf18, HOIL-1, HOIL1, PBMEI, RBCK2, RNF54, UBCE7IP3, XAP3, XAP4, ZRANB4, PGBM1, RANBP2-type and C3HC4-type zinc finger containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610924 MGI: 1344372 HomoloGene: 32448 GeneCards: RBCK1
Пов'язані генетичні захворювання
	polyglucosan body myopathy 1 with or without immunodeficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з іоном металу; • ubiquitin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • transferase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • LUBAC complex;
Біологічний процес	• negative regulation of necroptotic process; • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; • GO:0022415 viral process; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • T cell receptor signaling pathway; • protein linear polyubiquitination; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein polyubiquitination; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10616
	24105
	ENSG00000125826
	ENSMUSG00000027466
	Q9BYM8
	Q9WUB0
NM_006462; NM_031227; NM_031228; NM_031229; NM_001323956;
	NM_001323958; NM_001323960
	NM_001083921; NM_019705; NM_001355282
	NP_001310885; NP_001310887; NP_001310889; NP_006453; NP_112506
	NP_001077390; NP_062679; NP_001342211
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RBCK1 (англ. RANBP2-type and C3HC4-type zinc finger containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 510 амінокислот, а молекулярна маса — 57 572^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEKTKKAEE	MALSLTRAVA	GGDEQVAMKC	AIWLAEQRVP	LSVQLKPEVS
PTQDIRLWVS	VEDAQMHTVT	IWLTVRPDMT	VASLKDMVFL	DYGFPPVLQQ
WVIGQRLARD	QETLHSHGVR	QNGDSAYLYL	LSARNTSLNP	QELQRERQLR
MLEDLGFKDL	TLQPRGPLEP	GPPKPGVPQE	PGRGQPDAVP	EPPPVGWQCP
GCTFINKPTR	PGCEMCCRAR	PEAYQVPASY	QPDEEERARL	AGEEEALRQY
QQRKQQQQEG	NYLQHVQLDQ	RSLVLNTEPA	ECPVCYSVLA	PGEAVVLREC
LHTFCRECLQ	GTIRNSQEAE	VSCPFIDNTY	SCSGKLLERE	IKALLTPEDY
QRFLDLGISI	AENRSAFSYH	CKTPDCKGWC	FFEDDVNEFT	CPVCFHVNCL
LCKAIHEQMN	CKEYQEDLAL	RAQNDVAARQ	TTEMLKVMLQ	QGEAMRCPQC
QIVVQKKDGC	DWIRCTVCHT	EICWVTKGPR	WGPGGPGDTS	GGCRCRVNGI
PCHPSCQNCH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література ред.

Cong Y.-S., Yao Y.-L., Yang W.-M., Kuzhandaivelu N., Seto E. (1997). The hepatitis B virus X-associated protein, XAP3, is a protein kinase C-binding protein. J. Biol. Chem. 272: 16482—16489. PMID 9195957 DOI:10.1074/jbc.272.26.16482
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Beasley S.A., Safadi S.S., Barber K.R., Shaw G.S. (2012). Solution structure of the E3 ligase HOIL-1 Ubl domain. Protein Sci. 21: 1085—1092. PMID 22517668 DOI:10.1002/pro.2080