RAE1

RAE1 (англ. Ribonucleic acid export 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 368 амінокислот, а молекулярна маса — 40 968.

RAE1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3MMY, 4OWR
Ідентифікатори
Символи	RAE1, MIG14, MRNP41, Mnrp41, dJ481F12.3, dJ800J21.1, ribonucleic acid export 1, Gle2
Зовнішні ІД	OMIM: 603343 MGI: 1913929 HomoloGene: 2676 GeneCards: RAE1
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin binding Клітинна компонента • цитоплазма • Ядерна пора • клітинне ядро • nuclear envelope • fibrillar center • mitotic spindle pole • spindle pole • цитоскелет • host cell Біологічний процес • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • GO:0022415 viral process • regulation of mitotic spindle organization • transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery • RNA export from nucleus • protein import into nucleus • клітинний цикл • поділ клітини • mRNA export from nucleus • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8480	66679
Ensembl	ENSG00000101146	ENSMUSG00000027509
UniProt	P78406	Q8C570
RefSeq (мРНК)	NM_001015885 NM_003610	NM_175112
RefSeq (білок)	NP_001015885 NP_003601	NP_780321
Локус (UCSC)	Хр. 20: 57.35 – 57.38 Mb	Хр. 2: 172.84 – 172.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLFGTTSGF		GTSGTSMFGS		ATTDNHNPMK		DIEVTSSPDD		SIGCLSFSPP
TLPGNFLIAG		SWANDVRCWE		VQDSGQTIPK		AQQMHTGPVL		DVCWSDDGSK
VFTASCDKTA		KMWDLSSNQA		IQIAQHDAPV		KTIHWIKAPN		YSCVMTGSWD
KTLKFWDTRS		SNPMMVLQLP		ERCYCADVIY		PMAVVATAER		GLIVYQLENQ
PSEFRRIESP		LKHQHRCVAI		FKDKQNKPTG		FALGSIEGRV		AIHYINPPNP
AKDNFTFKCH		RSNGTNTSAP		QDIYAVNGIA		FHPVHGTLAT		VGSDGRFSFW
DKDARTKLKT		SEQLDQPISA		CCFNHNGNIF		AYASSYDWSK		GHEFYNPQKK
NYIFLRNAAE		ELKPRNKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• Kraemer D.M., Blobel G. (1997). mRNA binding protein mrnp 41 localizes to both nucleus and cytoplasm. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 9119—9124. PMID 9256445 DOI:10.1073/pnas.94.17.9119
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wong R.W., Blobel G., Coutavas E. (2006). Rae1 interaction with NuMA is required for bipolar spindle formation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 19783—19787. PMID 17172455 DOI:10.1073/pnas.0609582104
• Ren Y., Seo H.S., Blobel G., Hoelz A. (2010). Structural and functional analysis of the interaction between the nucleoporin Nup98 and the mRNA export factor Rae1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 10406—10411. PMID 20498086 DOI:10.1073/pnas.1005389107

Див. також

• Хромосома 20