PTPRT

PTPRT
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2OOQ
Ідентифікатори
Символи	PTPRT, RPTPrho, protein tyrosine phosphatase, receptor type T, protein tyrosine phosphatase receptor type T, RPTP-rho, R-PTP-T
Зовнішні ІД	OMIM: 608712 MGI: 1321152 HomoloGene: 56924 GeneCards: PTPRT
Пов'язані генетичні захворювання
	періодонтит
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein tyrosine phosphatase activity; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • beta-catenin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phosphoprotein phosphatase activity; • hydrolase activity; • alpha-catenin binding; • cadherin binding; • delta-catenin binding; • gamma-catenin binding; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • protein phosphatase binding; • protein homodimerization activity; • STAT family protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cell surface; • клітинна мембрана; • мембрана; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation; • адгезія клітин; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • negative regulation of cell migration; • cellular response to interleukin-6; • negative regulation of receptor signaling pathway via STAT; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation involved in inactivation of protein kinase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	11122
	19281
	ENSG00000196090
	ENSMUSG00000053141
	O14522
	Q99M80
	NM_007050; NM_133170; NM_001394024; NM_001394025; NM_001394026
	NM_001291149; NM_001291150; NM_001291151; NM_021464
	NP_008981; NP_573400
	NP_001278078; NP_001278079; NP_001278080; NP_067439
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRT (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type T) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 441 амінокислот, а молекулярна маса — 162 134^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASLAALALS	LLLRLQLPPL	PGARAQSAAG	GCSFDEHYSN	CGYSVALGTN
GFTWEQINTW	EKPMLDQAVP	TGSFMMVNSS	GRASGQKAHL	LLPTLKENDT
HCIDFHYYFS	SRDRSSPGAL	NVYVKVNGGP	QGNPVWNVSG	VVTEGWVKAE
LAISTFWPHF	YQVIFESVSL	KGHPGYIAVD	EVRVLAHPCR	KAPHFLRLQN
VEVNVGQNAT	FQCIAGGKWS	QHDKLWLQQW	NGRDTALMVT	RVVNHRRFSA
TVSVADTAQR	SVSKYRCVIR	SDGGSGVSNY	AELIVKEPPT	PIAPPELLAV
GATYLWIKPN	ANSIIGDGPI	ILKEVEYRTT	TGTWAETHIV	DSPNYKLWHL
DPDVEYEIRV	LLTRPGEGGT	GPPGPPLTTR	TKCADPVHGP	QNVEIVDIRA
RQLTLQWEPF	GYAVTRCHSY	NLTVQYQYVF	NQQQYEAEEV	IQTSSHYTLR
GLRPFMTIRL	RLLLSNPEGR	MESEELVVQT	EEDVPGAVPL	ESIQGGPFEE
KIYIQWKPPN	ETNGVITLYE	INYKAVGSLD	PSADLSSQRG	KVFKLRNETH
HLFVGLYPGT	TYSFTIKAST	AKGFGPPVTT	RIATKISAPS	MPEYDTDTPL
NETDTTITVM	LKPAQSRGAP	VSVYQLVVKE	ERLQKSRRAA	DIIECFSVPV
SYRNASSLDS	LHYFAAELKP	ANLPVTQPFT	VGDNKTYNGY	WNPPLSPLKS
YSIYFQALSK	ANGETKINCV	RLATKGASTQ	NSNTVEPEKQ	VDNTVKMAGV
IAGLLMFIII	LLGVMLTIKR	RRNAYSYSYY	LKLAKKQKET	QSGAQREMGP
VASADKPTTK	LSASRNDEGF	SSSSQDVNGF	TDGSRGELSQ	PTLTIQTHPY
RTCDPVEMSY	PRDQFQPAIR	VADLLQHITQ	MKRGQGYGFK	EEYEALPEGQ
TASWDTAKED	ENRNKNRYGN	IISYDHSRVR	LLVLDGDPHS	DYINANYIDG
YHRPRHYIAT	QGPMQETVKD	FWRMIWQENS	ASIVMVTNLV	EVGRVKCVRY
WPDDTEVYGD	IKVTLIETEP	LAEYVIRTFT	VQKKGYHEIR	ELRLFHFTSW
PDHGVPCYAT	GLLGFVRQVK	FLNPPEAGPI	VVHCSAGAGR	TGCFIAIDTM
LDMAENEGVV	DIFNCVRELR	AQRVNLVQTE	EQYVFVHDAI	LEACLCGNTA
IPVCEFRSLY	YNISRLDPQT	NSSQIKDEFQ	TLNIVTPRVR	PEDCSIGLLP
RNHDKNRSMD	VLPLDRCLPF	LISVDGESSN	YINAALMDSH	KQPAAFVVTQ
HPLPNTVADF	WRLVFDYNCS	SVVMLNEMDT	AQFCMQYWPE	KTSGCYGPIQ
VEFVSADIDE	DIIHRIFRIC	NMARPQDGYR	IVQHLQYIGW	PAYRDTPPSK
RSLLKVVRRL	EKWQEQYDGR	EGRTVVHCLN	GGGRSGTFCA	ICSVCEMIQQ
QNIIDVFHIV	KTLRNNKSNM	VETLEQYKFV	YEVALEYLSS	F

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література ред.

McAndrew P.E., Frostholm A., White R.A., Rotter A., Burghes A.H.M. (1998). Identification and characterization of RPTP rho, a novel RPTP mu/kappa-like receptor protein tyrosine phosphatase whose expression is restricted to the central nervous system. Brain Res. Mol. Brain Res. 56: 9—21. PMID 9602027 DOI:10.1016/S0169-328X(98)00014-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Besco J.A., Frostholm A., Popesco M.C., Burghes A.H.M., Rotter A. (2001). Genomic organization and alternative splicing of the human and mouse RPTPrho genes. BMC Genomics. 2: 1—1. PMID 11423001 DOI:10.1186/1471-2164-2-1
Besco J.A., Frostholm A., Popesco M.C., Burghes A.H.M., Rotter A. (2001). BMC Genomics. 2: 5—5. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 11814386 DOI:10.1186/1471-2164-2-5