PPWD1

PPWD1 (англ. Peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 646 амінокислот, а молекулярна маса — 73 575.

PPWD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2A2N
Ідентифікатори
Символи	PPWD1, peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 618274 MGI: 2443069 HomoloGene: 9099 GeneCards: PPWD1
Онтологія гена Молекулярна функція • isomerase activity • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • cyclosporin A binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • protein peptidyl-prolyl isomerization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23398	238831
Ensembl	ENSG00000113593	ENSMUSG00000021713
UniProt	Q96BP3	Q8CEC6
RefSeq (мРНК)	NM_001278926 NM_001278927 NM_001278929 NM_015342	NM_172807
RefSeq (білок)	NP_001265855 NP_001265856 NP_001265858 NP_056157	NP_766395
Локус (UCSC)	Хр. 5: 65.56 – 65.59 Mb	Хр. 13: 104.34 – 104.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAESGSDFQ		QRRRRRRDPE		EPEKTELSER		ELAVAVAVSQ		ENDEENEERW
VGPLPVEATL		AKKRKVLEFE		RVYLDNLPSA		SMYERSYMHR		DVITHVVCTK
TDFIITASHD		GHVKFWKKIE		EGIEFVKHFR		SHLGVIESIA		VSSEGALFCS
VGDDKAMKVF		DVVNFDMINM		LKLGYFPGQC		EWIYCPGDAI		SSVAASEKST
GKIFIYDGRG		DNQPLHIFDK		LHTSPLTQIR		LNPVYKAVVS		SDKSGMIEYW
TGPPHEYKFP		KNVNWEYKTD		TDLYEFAKCK		AYPTSVCFSP		DGKKIATIGS
DRKVRIFRFV		TGKLMRVFDE		SLSMFTELQQ		MRQQLPDMEF		GRRMAVEREL
EKVDAVRLIN		IVFDETGHFV		LYGTMLGIKV		INVETNRCVR		ILGKQENIRV
MQLALFQGIA		KKHRAATTIE		MKASENPVLQ		NIQADPTIVC		TSFKKNRFYM
FTKREPEDTK		SADSDRDVFN		EKPSKEEVMA		ATQAEGPKRV		SDSAIIHTSM
GDIHTKLFPV		ECPKTVENFC		VHSRNGYYNG		HTFHRIIKGF		MIQTGDPTGT
GMGGESIWGG		EFEDEFHSTL		RHDRPYTLSM		ANAGSNTNGS		QFFITVVPTP
WLDNKHTVFG		RVTKGMEVVQ		RISNVKVNPK		TDKPYEDVSI		INITVK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 5