PPIL1

PPIL1 (англ. Peptidylprolyl isomerase like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 166 амінокислот, а молекулярна маса — 18 237.

PPIL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XWN, 2K7N, 2X7K
Ідентифікатори
Символи	PPIL1, CYPL1, PPIase, hCyPX, CGI-124, peptidylprolyl isomerase like 1, PCH14
Зовнішні ІД	OMIM: 601301 MGI: 1916066 HomoloGene: 9367 GeneCards: PPIL1
Онтологія гена Молекулярна функція • isomerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • disordered domain specific binding • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • cyclosporin A binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • mRNA processing • згортання білків • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • protein peptidyl-prolyl isomerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51645	68816
Ensembl	ENSG00000137168	ENSMUSG00000024007
UniProt	Q9Y3C6	Q9D0W5
RefSeq (мРНК)	NM_016059	NM_026845
RefSeq (білок)	NP_057143	NP_081121
Локус (UCSC)	Хр. 6: 36.85 – 36.87 Mb	Хр. 17: 29.47 – 29.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAIPPDSWQ		PPNVYLETSM		GIIVLELYWK		HAPKTCKNFA		ELARRGYYNG
TKFHRIIKDF		MIQGGDPTGT		GRGGASIYGK		QFEDELHPDL		KFTGAGILAM
ANAGPDTNGS		QFFVTLAPTQ		WLDGKHTIFG		RVCQGIGMVN		RVGMVETNSQ
DRPVDDVKII		KAYPSG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Stegmann C.M., Luhrmann R., Wahl M.C. (2010). The crystal structure of PPIL1 bound to cyclosporine A suggests a binding mode for a linear epitope of the SKIP protein. PLoS ONE. 5: E10013—E10013. PMID 20368803 DOI:10.1371/journal.pone.0010013

Див. також

• Хромосома 6