PCDH11Y

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

PCDH11Y (англ. Protocadherin 11 Y-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 340 амінокислот, а молекулярна маса — 146 775[3].

PCDH11Y
Ідентифікатори
Символи PCDH11Y, PCDH-PC, PCDH22, PCDHX, PCDHY, protocadherin 11 Y-linked
Зовнішні ІД OMIM: 400022 GeneCards: PCDH11Y
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001278619
NM_032971
NM_032972
NM_032973
NM_001395587
н/д
RefSeq (білок)
NP_001265548
NP_116753
NP_116754
NP_116755
н/д
Локус (UCSC) Хр. Y: 5 – 5.74 Mb н/д
PubMed search [1] н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей
Послідовність амінокислот
1020304050
MFRVGFLIISSSSSLSPLLLVSVVRVNTTNCHKCLLSGTYIFAVLLVCVV
FHSGAQEKNYTIREEIPENVLIGNLLKDLNLSLIPNKSLTTTMQFKLVYK
TGDVPLIRIEEDTGEIFTTGARIDREKLCAGIPRDEHCFYEVEVAILPDE
IFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISIPENSAINSKYTLPAAVDPDV
GINGVQNYELIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELDREEKDTYVMK
VKVEDGGFPQRSSTAILQVSVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSV
TQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIARRLFHLNATTGLITIKEPLDRE
ETPNHKLLVLASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDIRYIVNPVNDTV
VLSENIPLNTKIALITVTDKDADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFLL
ENAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQSAMLFIKVKDENDNAPVFTQ
SFVTVSIPENNSPGIQLMKVSATDADSGPNAEINYLLGPDAPPEFSLDRR
TGMLTVVKKLDREKEDKYLFTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSP
VFTHNEYKFYVPENLPRHGTVGLITVTDPDYGDNSAVTLSILDENDDFTI
DSQTGVIRPNISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSAKVTINVVDVND
NKPVFIVPPYNYSYELVLPSTNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVGG
NTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHRVLVKANDLGQPDSLFSVVIV
NLFVNESVTNATLINELVRKSIEAPVTPNTEIADVSSPTSDYVKILVAAV
AGTITVVVVIFITAVVRCRQAPHLKAAQKNMQNSEWATPNPENRQMIMMK
KKKKKKKHSPKNLLLNVVTIEETKADDVDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGK
YNWVTTPTTFKPDSPDLARHYKSASPQPAFQIQPETPLNLKHHIIQELPL
DNTFVACDSISNCSSSSSDPYSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRPSQRRVTF
HLPEGSQESSSDGGLGDHDAGSLTSTSHGLPLGYPQEEYFDRATPSNRTE
GDGNSDPESTFIPGLKKEITVQPTVEEASDNCTQECLIYGHSDACWMPAS
LDHSSSSQAQASALCHSPPLSQASTQHHSPPVTQTIVLCHSPPVTQTIAL
CHSPPPIQVSALHHSPPLVQGTALHHSPPSAQASALCYSPPLAQAAAISH
SSSLPQVIALHRSQAQSSVSLQQGWVQGANGLCSVDQGVQGSATSQFYTM
SERLHPSDDSIKVIPLTTFAPRQQARPSRGDSPIMETHPL

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література ред.

  • Blanco P., Sargent C.A., Boucher C., Mitchell M., Affara N. (2000). Conservation of PCDHX in mammals; expression of human X/Y genes predominantly in brain. Mamm. Genome. 11: 906—914. PMID 11003707 DOI:10.1007/s003350010177
  • Blanco-Arias P., Sargent C.A., Affara N.A. (2004). Protocadherin X (PCDHX) and Y (PCDHY) genes; multiple mRNA isoforms encoding variant signal peptides and cytoplasmic domains. Mamm. Genome. 15: 41—52. PMID 14727141 DOI:10.1007/s00335-003-3028-7

Примітки ред.

  1. Human PubMed Reference:.
  2. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15813 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
  3. UniProt, Q9BZA8 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також ред.