OLFM3

OLFM3 (англ. Olfactomedin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 54 930.

OLFM3
Ідентифікатори
Символи	OLFM3, NOE3, NOELIN3, OPTIMEDIN, olfactomedin 3
Зовнішні ІД	OMIM: 607567 MGI: 2387329 HomoloGene: 17103 GeneCards: OLFM3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинні контакти • комплекс Ґольджі • AMPA glutamate receptor complex • синапс • міжклітинний простір Біологічний процес • eye photoreceptor cell development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	118427	229759
Ensembl	ENSG00000118733	ENSMUSG00000027965
UniProt	Q96PB7	P63056
RefSeq (мРНК)	NM_001288821 NM_001288823 NM_058170	NM_001286750 NM_153157 NM_153458
RefSeq (білок)	NP_001275750 NP_001275752 NP_477518	NP_001273679 NP_694797 NP_703188
Локус (UCSC)	Хр. 1: 101.8 – 102 Mb	Хр. 3: 114.7 – 114.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSPPLLKLGA		VLSTMAMISN		WMSQTLPSLV		GLNTTRLSTP		DTLTQISPKE
GWQVYSSAQD		PDGRCICTVV		APEQNLCSRD		AKSRQLRQLL		EKVQNMSQSI
EVLNLRTQRD		FQYVLKMETQ		MKGLKAKFRQ		IEDDRKTLMT		KHFQELKEKM
DELLPLIPVL		EQYKTDAKLI		TQFKEEIRNL		SAVLTGIQEE		IGAYDYEELH
QRVLSLETRL		RDCMKKLTCG		KLMKITGPVT		VKTSGTRFGA		WMTDPLASEK
NNRVWYMDSY		TNNKIVREYK		SIADFVSGAE		SRTYNLPFKW		AGTNHVVYNG
SLYFNKYQSN		IIIKYSFDMG		RVLAQRSLEY		AGFHNVYPYT		WGGFSDIDLM
ADEIGLWAVY		ATNQNAGNIV		ISQLNQDTLE		VMKSWSTGYP		KRSAGESFMI
CGTLYVTNSH		LTGAKVYYSY		STKTSTYEYT		DIPFHNQYFH		ISMLDYNARD
RALYAWNNGH		QVLFNVTLFH		IIKTEDDT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинних контактах, синапсах. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Torrado M., Trivedi R., Zinovieva R., Karavanova I., Tomarev S.I. (2002). Optimedin: a novel olfactomedin-related protein that interacts with myocilin. Hum. Mol. Genet. 11: 1291—1301. PMID 12019210 DOI:10.1093/hmg/11.11.1291
• Sultana A., Nakaya N., Senatorov V.V., Tomarev S.I. (2011). Olfactomedin 2: expression in the eye and interaction with other olfactomedin domain-containing proteins. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 52: 2584—2592. PMID 21228389 DOI:10.1167/iovs.10-6356
• Mukhopadhyay A., Talukdar S., Bhattacharjee A., Ray K. (2004). Bioinformatic approaches for identification and characterization of olfactomedin related genes with a potential role in pathogenesis of ocular disorders. Mol. Vis. 10: 304—314. PMID 15123989

Див. також

• Хромосома 1