NLRP6

NLRP6 (англ. NLR family pyrin domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 892 амінокислот, а молекулярна маса — 98 768.

NLRP6
Ідентифікатори
Символи	NLRP6, AVR, CLR11.4, NALP6, NAVR, NAVR/AVR, PAN3, PYPAF5, NLR family, pyrin domain containing 6, NLR family pyrin domain containing 6
Зовнішні ІД	OMIM: 609650 MGI: 2141990 HomoloGene: 15881 GeneCards: NLRP6
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • vasopressin receptor activity • ATP binding Клітинна компонента • цитоплазма • Ядерна мембрана • мембрана • клітинна мембрана • inflammasome complex • клітинне ядро Біологічний процес • response to bacterium • процес імунної системи • Загоєння ран • regulation of mucus secretion • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of immune response • regulation of autophagy • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • negative regulation of inflammatory response to antigenic stimulus • regulation of inflammatory response • negative regulation of MAPK cascade • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • вроджений імунітет • inflammatory response • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	171389	101613
Ensembl	ENSG00000174885	ENSMUSG00000038745
UniProt	P59044	Q91WS2
RefSeq (мРНК)	NM_001276700 NM_138329	NM_001081389 NM_133946
RefSeq (білок)	NP_001263629 NP_612202	NP_598707
Локус (UCSC)	Хр. 11: 0.28 – 0.29 Mb	Хр. 7: 140.5 – 140.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDQPEAPCSS		TGPRLAVARE		LLLAALEELS		QEQLKRFRHK		LRDVGPDGRS
IPWGRLERAD		AVDLAEQLAQ		FYGPEPALEV		ARKTLKRADA		RDVAAQLQER
RLQRLGLGSG		TLLSVSEYKK		KYREHVLQLH		ARVKERNARS		VKITKRFTKL
LIAPESAAPE		EAMGPAEEPE		PGRARRSDTH		TFNRLFRRDE		EGRRPLTVVL
QGPAGIGKTM		AAKKILYDWA		AGKLYQGQVD		FAFFMPCGEL		LERPGTRSLA
DLILDQCPDR		GAPVPQMLAQ		PQRLLFILDG		ADELPALGGP		EAAPCTDPFE
AASGARVLGG		LLSKALLPTA		LLLVTTRAAA		PGRLQGRLCS		PQCAEVRGFS
DKDKKKYFYK		YFRDERRAER		AYRFVKENET		LFALCFVPFV		CWIVCTVLRQ
QLELGRDLSR		TSKTTTSVYL		LFITSVLSSA		PVADGPRLQG		DLRNLCRLAR
EGVLGRRAQF		AEKELEQLEL		RGSKVQTLFL		SKKELPGVLE		TEVTYQFIDQ
SFQEFLAALS		YLLEDGGVPR		TAAGGVGTLL		RGDAQPHSHL		VLTTRFLFGL
LSAERMRDIE		RHFGCMVSER		VKQEALRWVQ		GQGQGCPGVA		PEVTEGAKGL
EDTEEPEEEE		EGEEPNYPLE		LLYCLYETQE		DAFVRQALCR		FPELALQRVR
FCRMDVAVLS		YCVRCCPAGQ		ALRLISCRLV		AAQEKKKKSL		GKRLQASLGG
GSSSQGTTKQ		LPASLLHPLF		QAMTDPLCHL		SSLTLSHCKL		PDAVCRDLSE
ALRAAPALTE		LGLLHNRLSE		AGLRMLSEGL		AWPQCRVQTV		RVQLPDPQRG
LQYLVGMLRQ		SPALTTLDLS		GCQLPAPMVT		YLCAVLQHQG		CGLQTLSLAS
VELSEQSLQE		LQAVKRAKPD		LVITHPALDG		HPQPPKELIS		TF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95—104. PMID 12563287 DOI:10.1038/nrm1019

Див. також

• Хромосома 11