NCOR1

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

NCOR1 (англ. Nuclear receptor corepressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 440 амінокислот, а молекулярна маса — 270 210[4].

NCOR1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NCOR1, N-CoR, N-CoR1, PPP1R109, TRAC1, hN-CoR, nuclear receptor corepressor 1
Зовнішні ІД OMIM: 600849 MGI: 1349717 HomoloGene: 38166 GeneCards: NCOR1
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001190438
NM_001190440
NM_006311
NM_001252313
NM_011308
NM_177229
RefSeq (білок)
NP_001177367
NP_001177369
NP_006302
н/д
Локус (UCSC) Хр. 17: 16.03 – 16.22 Mb Хр. 11: 62.21 – 62.35 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEV
SQASQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVD
HDSLESKRPRLEQVSDSHFQRVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFG
GKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQIL
KLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEA
HKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHAR
KQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIR
KQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQL
SVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKD
KFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRG
RNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDEKEDSKENTKE
KDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAA
AAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAI
AKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCE
SVASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPA
VELEPTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQ
QEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDVEVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRAS
EKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEPERQRMFP
MDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCTPCNIPI
GTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSP
NREWEVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPS
FIMGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSA
TLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLVRAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPT
SKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVKGSISRMPIEDSSPEKG
REEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLKRSYESV
EGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGT
PRATTESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRS
IHEIPRQDILTQESRKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIK
HNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTS
VVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSYQNTMSRGSPMMN
RTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSHSPFDPH
HRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQ
YQLYAMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATR
GIIDLTNMPPTILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSP
GHPTHLAAAASAEREREREREKERERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGS
HGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQLRIMPLPA
GGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKESKHEAARLE
ENLRSRSAAVSEQQQLEQKTLEVEKRSVQCLYTSSAFPSGKPQPHSSVVY
SEAGKDKGPPPKSRYEEELRTRGKTTITAANFIDVIITRQIASDKDARER
GSQSSDSSSSLSSHRYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKAN
QAENDPTRQYEGPLHHYRPQQESPSPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLIT
LADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQNSPSALVSTPVRTKTSNR
YSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVSSEPYEPI
SPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLEN
TSPMVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSR
GHSFADPASNLGLEDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTS
VVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERP
SSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQFPYNPLTMRMLSSTPPTP
IACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

ред.
  • Wang J., Hoshino T., Redner R.L., Kajigaya S., Liu J.M. (1998). ETO, fusion partner in t(8;21) acute myeloid leukemia, represses transcription by interaction with the human N-CoR/mSin3/HDAC1 complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 10860—10865. PMID 9724795 DOI:10.1073/pnas.95.18.10860
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Harding H.P., Atkins G.B., Jaffe A.B., Seo W.J., Lazar M.A. (1997). Transcriptional activation and repression by RORalpha, an orphan nuclear receptor required for cerebellar development. Mol. Endocrinol. 11: 1737—1746. PMID 9328355 DOI:10.1210/mend.11.11.0002
  • Underhill C., Qutob M.S., Yee S.P., Torchia J. (2000). A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1. J. Biol. Chem. 275: 40463—40470. PMID 11013263 DOI:10.1074/jbc.M007864200
  • Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2. Mol. Cell. 9: 611—623. PMID 11931768 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
  • Yoon H.-G., Chan D.W., Reynolds A.B., Qin J., Wong J. (2003). N-CoR mediates DNA methylation-dependent repression through a methyl CpG binding protein Kaiso. Mol. Cell. 12: 723—734. PMID 14527417 DOI:10.1016/j.molcel.2003.08.008

Примітки

ред.
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7672 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, O75376 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

ред.