NALCN

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

NALCN (англ. Sodium leak channel, non-selective) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 738 амінокислот, а молекулярна маса — 200 331[6].

NALCN
Ідентифікатори
Символи NALCN, CanIon, INNFD, VGCNL1, bA430M15.1, CLIFAHDD, IHPRF, IHPRF1, sodium leak channel, non-selective
Зовнішні ІД OMIM: 611549 MGI: 2444306 HomoloGene: 21832 GeneCards: NALCN
Пов'язані генетичні захворювання
недрібноклітинна карцинома легенів, congenital contractures of the limbs and face, hypotonia, and developmental delay, hypotonia, infantile, with psychomotor retardation and characteristic facies[1]
Реагує на сполуку
верапаміл[2]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_052867
NM_001350748
NM_001350749
NM_001350750
NM_001350751
NM_177393
NM_177754
RefSeq (білок)
NP_443099
NP_001337677
NP_001337678
NP_001337679
NP_001337680
NP_796367
Локус (UCSC) Хр. 13: 101.05 – 101.42 Mb Хр. 14: 123.28 – 123.63 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MLKRKQSSRVEAQPVTDFGPDESLSDNADILWINKPWVHSLLRICAIISV
ISVCMNTPMTFEHYPPLQYVTFTLDTLLMFLYTAEMIAKMHIRGIVKGDS
SYVKDRWCVFDGFMVFCLWVSLVLQVFEIADIVDQMSPWGMLRIPRPLIM
IRAFRIYFRFELPRTRITNILKRSGEQIWSVSIFLLFFLLLYGILGVQMF
GTFTYHCVVNDTKPGNVTWNSLAIPDTHCSPELEEGYQCPPGFKCMDLED
LGLSRQELGYSGFNEIGTSIFTVYEAASQEGWVFLMYRAIDSFPRWRSYF
YFITLIFFLAWLVKNVFIAVIIETFAEIRVQFQQMWGSRSSTTSTATTQM
FHEDAAGGWQLVAVDVNKPQGRAPACLQKMMRSSVFHMFILSMVTVDVIV
AASNYYKGENFRRQYDEFYLAEVAFTVLFDLEALLKIWCLGFTGYISSSL
HKFELLLVIGTTLHVYPDLYHSQFTYFQVLRVVRLIKISPALEDFVYKIF
GPGKKLGSLVVFTASLLIVMSAISLQMFCFVEELDRFTTFPRAFMSMFQI
LTQEGWVDVMDQTLNAVGHMWAPVVAIYFILYHLFATLILLSLFVAVILD
NLELDEDLKKLKQLKQSEANADTKEKLPLRLRIFEKFPNRPQMVKISKLP
SDFTVPKIRESFMKQFIDRQQQDTCCLLRSLPTTSSSSCDHSKRSAIEDN
KYIDQKLRKSVFSIRARNLLEKETAVTKILRACTRQRMLSGSFEGQPAKE
RSILSVQHHIRQERRSLRHGSNSQRISRGKSLETLTQDHSNTVRYRNAQR
EDSEIKMIQEKKEQAEMKRKVQEEELRENHPYFDKPLFIVGREHRFRNFC
RVVVRARFNASKTDPVTGAVKNTKYHQLYDLLGLVTYLDWVMIIVTICSC
ISMMFESPFRRVMHAPTLQIAEYVFVIFMSIELNLKIMADGLFFTPTAVI
RDFGGVMDIFIYLVSLIFLCWMPQNVPAESGAQLLMVLRCLRPLRIFKLV
PQMRKVVRELFSGFKEIFLVSILLLTLMLVFASFGVQLFAGKLAKCNDPN
IIRREDCNGIFRINVSVSKNLNLKLRPGEKKPGFWVPRVWANPRNFNFDN
VGNAMLALFEVLSLKGWVEVRDVIIHRVGPIHGIYIHVFVFLGCMIGLTL
FVGVVIANFNENKGTALLTVDQRRWEDLKSRLKIAQPLHLPPRPDNDGFR
AKMYDITQHPFFKRTIALLVLAQSVLLSVKWDVEDPVTVPLATMSVVFTF
IFVLEVTMKIIAMSPAGFWQSRRNRYDLLVTSLGVVWVVLHFALLNAYTY
MMGACVIVFRFFSICGKHVTLKMLLLTVVVSMYKSFFIIVGMFLLLLCYA
FAGVVLFGTVKYGENINRHANFSSAGKAITVLFRIVTGEDWNKIMHDCMV
QPPFCTPDEFTYWATDCGNYAGALMYFCSFYVIIAYIMLNLLVAIIVENF
SLFYSTEEDQLLSYNDLRHFQIIWNMVDDKREGVIPTFRVKFLLRLLRGR
LEVDLDKDKLLFKHMCYEMERLHNGGDVTFHDVLSMLSYRSVDIRKSLQL
EELLAREQLEYTIEEEVAKQTIRMWLKKCLKRIRAKQQQSCSIIHSLRES
QQQELSRFLNPPSIETTQPSEDTNANSQDNSMQPETSSQQQLLSPTLSDR
GGSRQDAADAGKPQRKFGQWRLPSAPKPISHSVSSVNLRFGGRTTMKSVV
CKMNPMTDAASCGSEVKKWWTRQLTVESDESGDDLLDI

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт натрію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном натрію. Локалізований у мембрані.

Література ред.

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Koeroglu C., Seven M., Tolun A. (2013). Recessive truncating NALCN mutation in infantile neuroaxonal dystrophy with facial dysmorphism. J. Med. Genet. 50: 515—520. PMID 23749988 DOI:10.1136/jmedgenet-2013-101634

Примітки ред.

Див. також ред.