NAF1

NAF1 (англ. Nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 494 амінокислот, а молекулярна маса — 53 717.

NAF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EQN
Ідентифікатори
Символи	NAF1, nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein
Зовнішні ІД	OMIM: 617868 MGI: 2682306 HomoloGene: 128518 GeneCards: NAF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • telomerase RNA binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex • клітинне ядро Біологічний процес • rRNA processing • pseudouridine synthesis • ribosome biogenesis • positive regulation of telomerase RNA localization to Cajal body • snoRNA guided rRNA pseudouridine synthesis • box H/ACA snoRNP assembly • RNA stabilization • positive regulation of telomerase activity • telomerase RNA stabilization • positive regulation of telomere maintenance via telomere lengthening • telomerase holoenzyme complex assembly • positive regulation of telomere maintenance via telomerase Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	92345	234344
Ensembl	ENSG00000145414	ENSMUSG00000014907
UniProt	Q96HR8	Q3UMQ8
RefSeq (мРНК)	NM_001128931 NM_138386	NM_001163564
RefSeq (білок)	NP_001122403 NP_612395	NP_001157036
Локус (UCSC)	Хр. 4: 163.11 – 163.17 Mb	Хр. 8: 67.31 – 67.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVVEAAAAQ		LETLKFNGTD		FGVGEGPAAP		SPGSAPVPGT		QPPLQSFEGS
PDAGQTVEVK		PAGEQPLQPV		LNAVAAGTPA		PQPQPPAESP		ACGDCVTSPG
AAEPARAPDS		LETSDSDSDS		DSETDSDSSS		SSSSSSSSSS		SSSSSCISLP
PVLSDGDDDL		QIEKENKNFP		LKTKDELLLN		ELPSVEELTI		ILPEDIELKP
LGMVSSIIEQ		LVIIESMTNL		PPVNEETVIF		KSDRQAAGKI		FEIFGPVAHP
FYVLRFNSSD		HIESKGIKIK		ETMYFAPSMK		DFTQYIFTEK		LKQDKGSDAS
WKNDQEPPPE		ALDFSDDEKE		KEAKQRKKSQ		IQGRKKLKSE		FNEPGEDFTE
VHQNWNAHSS		ASEHAKGYRN		REFTRGFSRA		RYPRSCHGRP		PPQHFYNSEH
MVSQETSGFP		SQRQNNPIMP		QYPFPLPVFD		MHNFPLRPPP		PPPPPPVNMG
WATPNMAAHP		LLNLPYSLPP		PPPPPPLPPP		PSSGDSNSHF		GPYY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hoareau-Aveilla C., Bonoli M., Caizergues-Ferrer M., Henry Y. (2006). hNaf1 is required for accumulation of human box H/ACA snoRNPs, scaRNPs, and telomerase. RNA. 12: 832—840. PMID 16601202 DOI:10.1261/rna.2344106
• Kittur N., Darzacq X., Roy S., Singer R.H., Meier U.T. (2006). Dynamic association and localization of human H/ACA RNP proteins. RNA. 12: 2057—2062. PMID 17135485 DOI:10.1261/rna.249306

Див. також

• Хромосома 4