MAP1LC3B

MAP1LC3B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1V49, 2LUE, 2ZJD, 3VTU, 3VTV, 3VTW, 3WAO, 3X0W, 4WAA, 5D94, 5DCN
Ідентифікатори
Символи	MAP1LC3B, ATG8F, LC3B, MAP1A/1BLC3, MAP1LC3B-a, microtubule associated protein 1 light chain 3 beta
Зовнішні ІД	OMIM: 609604 MGI: 1914693 HomoloGene: 69359 GeneCards: MAP1LC3B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ubiquitin protein ligase binding; • microtubule binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • organelle membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинний; • мітохондрія; • GO:0035085 Аксонема; • мікротрубочка; • цитоскелет; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • система ендомембран; • autophagosome membrane; • гіалоплазма; • autophagosome; • autolysosome;
Біологічний процес	• autophagy of mitochondrion; • autophagosome assembly; • автофагія; • cellular response to nitrogen starvation; • cellular response to starvation; • macroautophagy; • GO:0000046 autophagosome maturation; • positive regulation of mucus secretion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	81631
	67443
	ENSG00000140941
	ENSMUSG00000031812
	Q9GZQ8
	Q9CQV6
	NM_022818
	NM_026160; NM_001364358
	NP_073729
	NP_080436; NP_001351287
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MAP1LC3B (англ. Microtubule associated protein 1 light chain 3 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 125 амінокислот, а молекулярна маса — 14 688^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSEKTFKQR	RTFEQRVEDV	RLIREQHPTK	IPVIIERYKG	EKQLPVLDKT
KFLVPDHVNM	SELIKIIRRR	LQLNANQAFF	LLVNGHSMVS	VSTPISEVYE
SEKDEDGFLY	MVYASQETFG	MKLSV

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, автофагія. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Відкриття ред.

LC3 спочатку був визначений як білок, пов'язаний з мікротрубками у мозку щура.^[5] Однак пізніше виявилося, що основна функція LC3 полягає в автофагії — процесі масового розщеплення компонентів цитоплазми.

Структура ред.

LC3 має структурну гомологію з убіквітином і, отже, був названий білком, схожим на убіквітин.^[6] У LC3 є місце зв'язування LDS (LIR docking site) / гідрофобного зв'язувального інтерфейсу на N-кінці, яке взаємодіє з білками, що містять область взаємодії з LC3 (LIR, LC3 Interacting Region). ^[7] Цей домен багатий на гідрофобні амінокислоти, мутація яких погіршує здатність LC3 зв'язуватися з білками, що містять LIR, багато з яких є адаптерними білками для автофагії. Наприклад, секвестозом (SQSTM1) взаємодіє з фенілаланіном 52 та лейцином 53, які присутні в гідрофобному зв'язувальному інтерфейсі LC3, і будь-яка мутація цих амінокислот запобігає взаємодії LC3 з SQSTM1.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tanida I., Ueno T., Kominami E. (2004). Human light chain 3/MAP1LC3B is cleaved at its carboxyl-terminal Met121 to expose Gly120 for lipidation and targeting to autophagosomal membranes. J. Biol. Chem. 279: 47704—47710. PMID 15355958 DOI:10.1074/jbc.M407016200
Tanida I., Ueno T., Kominami E. (2004). LC3 conjugation system in mammalian autophagy. Int. J. Biochem. Cell Biol. 36: 2503—2518. PMID 15325588 DOI:10.1016/j.biocel.2004.05.009
Behrends C., Sowa M.E., Gygi S.P., Harper J.W. (2010). Network organization of the human autophagy system. Nature. 466: 68—76. PMID 20562859 DOI:10.1038/nature09204
Itoh T., Kanno E., Uemura T., Waguri S., Fukuda M. (2011). OATL1, a novel autophagosome-resident Rab33B-GAP, regulates autophagosomal maturation. J. Cell Biol. 192: 839—853. PMID 21383079 DOI:10.1083/jcb.201008107
Lee D.Y., Arnott D., Brown E.J. (2013). Ubiquilin4 is an adaptor protein that recruits Ubiquilin1 to the autophagy machinery. EMBO Rep. 14: 373—381. PMID 23459205 DOI:10.1038/embor.2013.22

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13352 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9GZQ8 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ Mann SS, Hammarback JA (April 1994). Molecular characterization of light chain 3. A microtubule binding subunit of MAP1A and MAP1B. The Journal of Biological Chemistry. 269 (15): 11492—7. doi:10.1016/S0021-9258(19)78150-2. PMID 7908909.
↑ Kouno T, Mizuguchi M, Tanida I, Ueno T, Kanematsu T, Mori Y, Shinoda H, Hirata M, Kominami E, Kawano K (July 2005). Solution structure of microtubule-associated protein light chain 3 and identification of its functional subdomains. The Journal of Biological Chemistry (англ.). 280 (26): 24610—7. doi:10.1074/jbc.M413565200. PMID 15857831.
↑ Kraft LJ, Nguyen TA, Vogel SS, Kenworthy AK (May 2014). Size, stoichiometry, and organization of soluble LC3-associated complexes. Autophagy. 10 (5): 861—77. doi:10.4161/auto.28175. PMC 4768459. PMID 24646892.

Див. також ред.

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13352 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9GZQ8 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[5] Mann SS, Hammarback JA (April 1994). Molecular characterization of light chain 3. A microtubule binding subunit of MAP1A and MAP1B. The Journal of Biological Chemistry. 269 (15): 11492—7. doi:10.1016/S0021-9258(19)78150-2. PMID 7908909.

[6] Kouno T, Mizuguchi M, Tanida I, Ueno T, Kanematsu T, Mori Y, Shinoda H, Hirata M, Kominami E, Kawano K (July 2005). Solution structure of microtubule-associated protein light chain 3 and identification of its functional subdomains. The Journal of Biological Chemistry (англ.). 280 (26): 24610—7. doi:10.1074/jbc.M413565200. PMID 15857831.

[ReferenceA-7] Kraft LJ, Nguyen TA, Vogel SS, Kenworthy AK (May 2014). Size, stoichiometry, and organization of soluble LC3-associated complexes. Autophagy. 10 (5): 861—77. doi:10.4161/auto.28175. PMC 4768459. PMID 24646892.

[3]

[4]

[1]

[2]

[5]

[6]

[7]