ITGA1

ITGA1 (англ. Integrin subunit alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 179 амінокислот, а молекулярна маса — 130 848.

ITGA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1PT6, 1QC5, 1QCY, 2L8S, 4A0Q, 2M32
Ідентифікатори
Символи	ITGA1, CD49a, VLA1, integrin subunit alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 192968 MGI: 96599 HomoloGene: 57137 GeneCards: ITGA1
Онтологія гена Молекулярна функція • collagen binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • collagen binding involved in cell-matrix adhesion • protein phosphatase binding • signaling receptor binding Клітинна компонента • integral component of membrane • перикаріон • integrin alpha1-beta1 complex • мембрана • focal adhesion • basal part of cell • клітинна мембрана • cell surface • integrin complex • Акросома • membrane raft • neuron projection • екзосома • external side of plasma membrane Біологічний процес • neuron projection morphogenesis • м'язове скорочення • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • extracellular matrix organization • вазодилатація • neutrophil chemotaxis • positive regulation of neuron apoptotic process • positive regulation of phosphoprotein phosphatase activity • адгезія клітин • cell chemotaxis • integrin-mediated signaling pathway • cellular extravasation • cell-matrix adhesion • negative regulation of cell population proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3672	109700
Ensembl	ENSG00000213949	ENSMUSG00000042284
UniProt	P56199	Q3V3R4
RefSeq (мРНК)	NM_181501	NM_001033228
RefSeq (білок)	NP_852478	NP_001028400
Локус (UCSC)	Хр. 5: 52.79 – 52.96 Mb	Хр. 13: 115.09 – 115.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPRPRARPG		VAVACCWLLT		VVLRCCVSFN		VDVKNSMTFS		GPVEDMFGYT
VQQYENEEGK		WVLIGSPLVG		QPKNRTGDVY		KCPVGRGESL		PCVKLDLPVN
TSIPNVTEVK		ENMTFGSTLV		TNPNGGFLAC		GPLYAYRCGH		LHYTTGICSD
VSPTFQVVNS		IAPVQECSTQ		LDIVIVLDGS		NSIYPWDSVT		AFLNDLLERM
DIGPKQTQVG		IVQYGENVTH		EFNLNKYSST		EEVLVAAKKI		VQRGGRQTMT
ALGIDTARKE		AFTEARGARR		GVKKVMVIVT		DGESHDNHRL		KKVIQDCEDE
NIQRFSIAIL		GSYNRGNLST		EKFVEEIKSI		ASEPTEKHFF		NVSDELALVT
IVKTLGERIF		ALEATADQSA		ASFEMEMSQT		GFSAHYSQDW		VMLGAVGAYD
WNGTVVMQKA		SQIIIPRNTT		FNVESTKKNE		PLASYLGYTV		NSATASSGDV
LYIAGQPRYN		HTGQVIIYRM		EDGNIKILQT		LSGEQIGSYF		GSILTTTDID
KDSNTDILLV		GAPMYMGTEK		EEQGKVYVYA		LNQTRFEYQM		SLEPIKQTCC
SSRQHNSCTT		ENKNEPCGAR		FGTAIAAVKD		LNLDGFNDIV		IGAPLEDDHG
GAVYIYHGSG		KTIRKEYAQR		IPSGGDGKTL		KFFGQSIHGE		MDLNGDGLTD
VTIGGLGGAA		LFWSRDVAVV		KVTMNFEPNK		VNIQKKNCHM		EGKETVCINA
TVCFDVKLKS		KEDTIYEADL		QYRVTLDSLR		QISRSFFSGT		QERKVQRNIT
VRKSECTKHS		FYMLDKHDFQ		DSVRITLDFN		LTDPENGPVL		DDSLPNSVHE
YIPFAKDCGN		KEKCISDLSL		HVATTEKDLL		IVRSQNDKFN		VSLTVKNTKD
SAYNTRTIVH		YSPNLVFSGI		EAIQKDSCES		NHNITCKVGY		PFLRRGEMVT
FKILFQFNTS		YLMENVTIYL		SATSDSEEPP		ETLSDNVVNI		SIPVKYEVGL
QFYSSASEYH		ISIAANETVP		EVINSTEDIG		NEINIFYLIR		KSGSFPMPEL
KLSISFPNMT		SNGYPVLYPT		GLSSSENANC		RPHIFEDPFS		INSGKKMTTS
TDHLKRGTIL		DCNTCKFATI		TCNLTSSDIS		QVNVSLILWK		PTFIKSYFSS
LNLTIRGELR		SENASLVLSS		SNQKRELAIQ		ISKDGLPGRV		PLWVILLSAF
AGLLLLMLLI		LALWKIGFFK		RPLKKKMEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Briesewitz R., Epstein M.R., Marcantonio E.E. (1993). Expression of native and truncated forms of the human integrin alpha 1 subunit. J. Biol. Chem. 268: 2989—2996. PMID 8428973

Див. також

• Хромосома 5