HNRNPH1

HNRNPH1 (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 449 амінокислот, а молекулярна маса — 49 229.

HNRNPH1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LXU
Ідентифікатори
Символи	HNRNPH1, HNRPH, HNRPH1, hnRNPH, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1 (H), heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1
Зовнішні ІД	OMIM: 601035 MGI: 1891925 HomoloGene: 31318 GeneCards: HNRNPH1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • poly(U) RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • мембрана • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • regulation of RNA splicing • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Сплайсинг РНК • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • RNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3187	59013
Ensembl	ENSG00000169045	ENSMUSG00000007850
UniProt	P31943	O35737
RefSeq (мРНК)	NM_001257293 NM_005520 NM_001363572	NM_021510 NM_001347487
RefSeq (білок)	NP_001244222 NP_005511 NP_001350501 NP_001351154 NP_001351155 NP_001351156 NP_001351157 NP_001351158 NP_001351159 NP_001351160 NP_001351161 NP_001351162 NP_001351163 NP_001351164 NP_001351165 NP_001351166 NP_001351167 NP_001351168 NP_001351169 NP_001351170 NP_001351171 NP_001351172 NP_001351173 NP_001351174 NP_001351175 NP_001351176 NP_001351177 NP_001351179 NP_001351180 NP_001351181 NP_001351182 NP_001351183 NP_001351184	NP_001334416 NP_067485 NP_001349451 NP_001349452 NP_001349453 NP_001349454 NP_001349455 NP_001349456 NP_001349457 NP_001349458 NP_001349459 NP_001349461 NP_001349462 NP_001349463
Локус (UCSC)	Хр. 5: 179.61 – 179.63 Mb	Хр. 11: 50.38 – 50.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMLGTEGGEG		FVVKVRGLPW		SCSADEVQRF		FSDCKIQNGA		QGIRFIYTRE
GRPSGEAFVE		LESEDEVKLA		LKKDRETMGH		RYVEVFKSNN		VEMDWVLKHT
GPNSPDTAND		GFVRLRGLPF		GCSKEEIVQF		FSGLEIVPNG		ITLPVDFQGR
STGEAFVQFA		SQEIAEKALK		KHKERIGHRY		IEIFKSSRAE		VRTHYDPPRK
LMAMQRPGPY		DRPGAGRGYN		SIGRGAGFER		MRRGAYGGGY		GGYDDYNGYN
DGYGFGSDRF		GRDLNYCFSG		MSDHRYGDGG		STFQSTTGHC		VHMRGLPYRA
TENDIYNFFS		PLNPVRVHIE		IGPDGRVTGE		ADVEFATHED		AVAAMSKDKA
NMQHRYVELF		LNSTAGASGG		AYEHRYVELF		LNSTAGASGG		AYGSQMMGGM
GLSNQSSYGG		PASQQLSGGY		GGGYGGQSSM		SGYDQVLQEN		SSDFQSNIA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Matunis M.J., Xing J., Dreyfuss G. (1994). The hnRNP F protein: unique primary structure, nucleic acid-binding properties, and subcellular localization. Nucleic Acids Res. 22: 1059—1067. PMID 7512260 DOI:10.1093/nar/22.6.1059
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 5