HDAC9

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

HDAC9 (англ. Histone deacetylase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 011 амінокислот, а молекулярна маса — 111 297[6].

HDAC9
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи HDAC9, HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, histone deacetylase 9
Зовнішні ІД OMIM: 606543 MGI: 1931221 HomoloGene: 128578 GeneCards: HDAC9
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, інсульт, неспецифічний виразковий коліт, цереброваскулярні хвороби[1]
Реагує на сполуку
belinostat, entinostat, givinostat, panobinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A, золінза[2]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001271386
NM_024124
RefSeq (білок)
NP_001258315
NP_077038
Локус (UCSC) Хр. 7: 18.09 – 19 Mb Хр. 12: 34.1 – 34.97 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQLQQEL
LLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKELLAIKQQQELL
EKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEF
LLSKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYK
YTLPGAQDAKDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNV
VTSFKKRMFEVTESSVSSSSPGSGPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHA
EQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVPSQLNASNSLKEK
QKCETQTLRQGVPLPGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNSSHQALLQHLL
LKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLNRTQ
SAPLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGS
HLEEAEEELQGDQAMQEDRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEE
PVDSDEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGL
EKHRLVSRTHSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGN
STTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSL
LYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGA
ARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAI
TAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNF
FPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAK
EFDPDMVLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVL
ALEGGHDLTAICDASEACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKI
IEIQSMSLKFS

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

ред.
  • Zhou X., Marks P.A., Rifkind R.A., Richon V.M. (2001). Cloning and characterization of a histone deacetylase, HDAC9. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10572—10577. PMID 11535832 DOI:10.1073/pnas.191375098
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhou X., Richon V.M., Rifkind R.A., Marks P.A. (2000). Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 1056—1061. PMID 10655483 DOI:10.1073/pnas.97.3.1056

Примітки

ред.

Див. також

ред.