GALNT13

GALNT13
Ідентифікатори
Символи	GALNT13, GalNAc-T13, polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13
Зовнішні ІД	OMIM: 608369 MGI: 2139447 HomoloGene: 62167 GeneCards: GALNT13
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• glycosyltransferase activity; • transferase activity; • зв'язування з іоном металу; • carbohydrate binding; • polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • Golgi membrane; • комплекс Ґольджі; • мембрана;
Біологічний процес	• GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation; • O-glycan processing; • protein O-linked glycosylation; • protein O-linked glycosylation via serine; • protein O-linked glycosylation via threonine;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	114805
	271786
	ENSG00000144278
	ENSMUSG00000060988
	Q8IUC8
	Q8CF93
	NM_001301627; NM_052917
	NM_173030
NP_001288556; NP_443149; NP_001363321; NP_001363323; NP_001363327;
	NP_001363329; NP_001363330; NP_001363331; NP_001363332; NP_001363333; NP_001363334
	NP_766618
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GALNT13 (англ. Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 556 амінокислот, а молекулярна маса — 64 051^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRRFVYCKVV	LATSLMWVLV	DVFLLLYFSE	CNKCDDKKER	SLLPALRAVI
SRNQEGPGEM	GKAVLIPKDD	QEKMKELFKI	NQFNLMASDL	IALNRSLPDV
RLEGCKTKVY	PDELPNTSVV	IVFHNEAWST	LLRTVYSVIN	RSPHYLLSEV
ILVDDASERD	FLKLTLENYV	KNLEVPVKII	RMEERSGLIR	ARLRGAAASK
GQVITFLDAH	CECTLGWLEP	LLARIKEDRK	TVVCPIIDVI	SDDTFEYMAG
SDMTYGGFNW	KLNFRWYPVP	QREMDRRKGD	RTLPVRTPTM	AGGLFSIDRN
YFEEIGTYDA	GMDIWGGENL	EMSFRIWQCG	GSLEIVTCSH	VGHVFRKATP
YTFPGGTGHV	INKNNRRLAE	VWMDEFKDFF	YIISPGVVKV	DYGDVSVRKT
LRENLKCKPF	SWYLENIYPD	SQIPRRYYSL	GEIRNVETNQ	CLDNMGRKEN
EKVGIFNCHG	MGGNQVFSYT	ADKEIRTDDL	CLDVSRLNGP	VIMLKCHHMR
GNQLWEYDAE	RLTLRHVNSN	QCLDEPSEED	KMVPTMQDCS	GSRSQQWLLR
NMTLGT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, лектинами, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179