FOXA1

FOXA1 (англ. Forkhead box A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 472 амінокислот, а молекулярна маса — 49 148.

FOXA1
Ідентифікатори
Символи	FOXA1, HNF3A, TCF3A, forkhead box A1
Зовнішні ІД	OMIM: 602294 MGI: 1347472 HomoloGene: 3307 GeneCards: FOXA1
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • Мікроворсинки • клітинне ядро • fibrillar center • нуклеоплазма Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • prostate gland stromal morphogenesis • dopaminergic neuron differentiation • positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • response to estradiol • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lung morphogenesis • glucose homeostasis • positive regulation of smoothened signaling pathway • lung development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron fate specification • anatomical structure formation involved in morphogenesis • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • tube morphogenesis • secretory columnal luminar epithelial cell differentiation involved in prostate glandular acinus development • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • multicellular organism development • prostate gland epithelium morphogenesis • connective tissue development • positive regulation of neuron differentiation • epithelial cell maturation involved in prostate gland development • регуляція експресії генів • lung epithelial cell differentiation • dorsal/ventral neural tube patterning • epithelial-mesenchymal signaling involved in prostate gland development • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • respiratory basal cell differentiation • hormone metabolic process • alveolar secondary septum development • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ремоделювання хроматину • anatomical structure morphogenesis • positive regulation of apoptotic process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3169	15375
Ensembl	ENSG00000129514	ENSMUSG00000035451
UniProt	P55317	P35582
RefSeq (мРНК)	NM_004496	NM_008259
RefSeq (білок)	NP_004487	NP_032285
Локус (UCSC)	Хр. 14: 37.59 – 37.6 Mb	Хр. 12: 57.59 – 57.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGTVKMEGH		ETSDWNSYYA		DTQEAYSSVP		VSNMNSGLGS		MNSMNTYMTM
NTMTTSGNMT		PASFNMSYAN		PGLGAGLSPG		AVAGMPGGSA		GAMNSMTAAG
VTAMGTALSP		SGMGAMGAQQ		AASMNGLGPY		AAAMNPCMSP		MAYAPSNLGR
SRAGGGGDAK		TFKRSYPHAK		PPYSYISLIT		MAIQQAPSKM		LTLSEIYQWI
MDLFPYYRQN		QQRWQNSIRH		SLSFNDCFVK		VARSPDKPGK		GSYWTLHPDS
GNMFENGCYL		RRQKRFKCEK		QPGAGGGGGS		GSGGSGAKGG		PESRKDPSGA
SNPSADSPLH		RGVHGKTGQL		EGAPAPGPAA		SPQTLDHSGA		TATGGASELK
TPASSTAPPI		SSGPGALASV		PASHPAHGLA		PHESQLHLKG		DPHYSFNHPF
SINNLMSSSE		QQHKLDFKAY		EQALQYSPYG		STLPASLPLG		SASVTTRSPI
EPSALEPAYY		QGVYSRPVLN		TS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Bingle C.D., Gowan S. (1996). Molecular cloning of the forkhead transcription factor HNF-3 alpha from a human pulmonary adenocarcinoma cell line. Biochim. Biophys. Acta. 1307: 17—20. PMID 8652662 DOI:10.1016/0167-4781(96)00058-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14