EXD2

EXD2 (англ. Exonuclease 3'-5' domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 621 амінокислот, а молекулярна маса — 70 353.

EXD2
Ідентифікатори
Символи	EXD2, C14orf114, EXDL2, exonuclease 3'-5' domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 616940 MGI: 1922485 HomoloGene: 10066 GeneCards: EXD2
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity • exodeoxyribonuclease I activity • 3'-5' exonuclease activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • nucleobase-containing compound metabolic process • DNA double-strand break processing • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • double-strand break repair via homologous recombination • double-strand break repair Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55218	97827
Ensembl	ENSG00000081177	ENSMUSG00000032705
UniProt	Q9NVH0	Q8VEG4
RefSeq (мРНК)	NM_001193360 NM_001193361 NM_001193362 NM_001193363 NM_018199	NM_133798
RefSeq (білок)	NP_001180289 NP_001180290 NP_001180291 NP_001180292 NP_060669	NP_598559
Локус (UCSC)	Хр. 14: 69.19 – 69.24 Mb	Хр. 12: 80.51 – 80.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRQNLVALT		VTTLLGVAVG		GFVLWKGIQR		RRRSKTSPVT		QQPQQKVLGS
RELPPPEDDQ		LHSSAPRSSW		KERILKAKVV		TVSQEAEWDQ		IEPLLRSELE
DFPVLGIDCE		WVNLEGKASP		LSLLQMASPS		GLCVLVRLPK		LICGGKTLPR
TLLDILADGT		ILKVGVGCSE		DASKLLQDYG		LVVRGCLDLR		YLAMRQRNNL
LCNGLSLKSL		AETVLNFPLD		KSLLLRCSNW		DAETLTEDQV		IYAARDAQIS
VALFLHLLGY		PFSRNSPGEK		NDDHSSWRKV		LEKCQGVVDI		PFRSKGMSRL
GEEVNGEATE		SQQKPRNKKS		KMDGMVPGNH		QGRDPRKHKR		KPLGVGYSAR
KSPLYDNCFL		HAPDGQPLCT		CDRRKAQWYL		DKGIGELVSE		EPFVVKLRFE
PAGRPESPGD		YYLMVKENLC		VVCGKRDSYI		RKNVIPHEYR		KHFPIEMKDH
NSHDVLLLCT		SCHAISNYYD		NHLKQQLAKE		FQAPIGSEEG		LRLLEDPERR
QVRSGARALL		NAESLPTQRK		EELLQALREF		YNTDVVTEEM		LQEAASLETR
ISNENYVPHG		LKVVQCHSQG		GLRSLMQLES		RWRQHFLDSM		QPKHLPQQWS
VDHNHQKLLR		KFGEDLPIQL		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14