DDX17

DDX17 (англ. DEAD-box helicase 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 729 амінокислот, а молекулярна маса — 80 272.

DDX17
Ідентифікатори
Символи	DDX17, P72, RH70, DEAD-box helicase 17
Зовнішні ІД	OMIM: 608469 MGI: 1914290 HomoloGene: 101101 GeneCards: DDX17
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • RNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • hydrolase activity • nucleic acid binding • ATP-dependent activity, acting on RNA • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • клітинне ядро • nuclear speck • гіалоплазма • нуклеоплазма • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • RNA secondary structure unwinding • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • regulation of skeletal muscle cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Альтернативний сплайсинг • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0061715 miRNA metabolic process • intracellular estrogen receptor signaling pathway • androgen receptor signaling pathway • Епітеліально-мезенхімальний перехід • myoblast differentiation • процес імунної системи • rRNA processing • mRNA processing • Сплайсинг РНК • Сайленсинг генів • defense response to virus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10521	67040
Ensembl	ENSG00000100201	ENSMUSG00000055065
UniProt	Q92841	Q501J6
RefSeq (мРНК)	NM_030881 NM_001098504 NM_001098505 NM_006386	NM_001040187 NM_152806 NM_199079 NM_199080
RefSeq (білок)	NP_001091974 NP_006377	NP_001035277 NP_690019 NP_951061 NP_951062
Локус (UCSC)	Хр. 22: 38.48 – 38.51 Mb	Хр. 15: 79.41 – 79.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPTGFVAPIL		CVLLPSPTRE		AATVASATGD		SASERESAAP		AAAPTAEAPP
PSVVTRPEPQ		ALPSPAIRAP		LPDLYPFGTM		RGGGFGDRDR		DRDRGGFGAR
GGGGLPPKKF		GNPGERLRKK		KWDLSELPKF		EKNFYVEHPE		VARLTPYEVD
ELRRKKEITV		RGGDVCPKPV		FAFHHANFPQ		YVMDVLMDQH		FTEPTPIQCQ
GFPLALSGRD		MVGIAQTGSG		KTLAYLLPAI		VHINHQPYLE		RGDGPICLVL
APTRELAQQV		QQVADDYGKC		SRLKSTCIYG		GAPKGPQIRD		LERGVEICIA
TPGRLIDFLE		SGKTNLRRCT		YLVLDEADRM		LDMGFEPQIR		KIVDQIRPDR
QTLMWSATWP		KEVRQLAEDF		LRDYTQINVG		NLELSANHNI		LQIVDVCMES
EKDHKLIQLM		EEIMAEKENK		TIIFVETKRR		CDDLTRRMRR		DGWPAMCIHG
DKSQPERDWV		LNEFRSGKAP		ILIATDVASR		GLDVEDVKFV		INYDYPNSSE
DYVHRIGRTA		RSTNKGTAYT		FFTPGNLKQA		RELIKVLEEA		NQAINPKLMQ
LVDHRGGGGG		GGGRSRYRTT		SSANNPNLMY		QDECDRRLRG		VKDGGRRDSA
SYRDRSETDR		AGYANGSGYG		SPNSAFGAQA		GQYTYGQGTY		GAAAYGTSSY
TAQEYGAGTY		GASSTTSTGR		SSQSSSQQFS		GIGRSGQQPQ		PLMSQQFAQP
PGATNMIGYM		GQTAYQYPPP		PPPPPPSRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Lamm G.M., Nicol S.M., Fuller-Pace F.V., Lamond A.I. (1996). p72: a human nuclear DEAD box protein highly related to p68. Nucleic Acids Res. 24: 3739—3747. PMID 8871553 DOI:10.1093/nar/24.19.3739
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Uhlmann-Schiffler H., Rossler O.G., Stahl H. (2002). The mRNA of DEAD box protein p72 is alternatively translated into an 82-kDa RNA helicase. J. Biol. Chem. 277: 1066—1075. PMID 11675387 DOI:10.1074/jbc.M107535200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Shin S., Janknecht R. (2007). Concerted activation of the Mdm2 promoter by p72 RNA helicase and the coactivators p300 and P/CAF. J. Cell. Biochem. 101: 1252—1265. PMID 17226766 DOI:10.1002/jcb.21250
• Chen G., Guo X., Lv F., Xu Y., Gao G. (2008). p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 4352—4357. PMID 18334637 DOI:10.1073/pnas.0712276105

Див. також

• Хромосома 22