DCK

DCK (англ. Deoxycytidine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 30 519.

DCK
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P5Z, 1P60, 1P61, 1P62, 2A2Z, 2A30, 2A7Q, 2NO0, 2NO1, 2NO6, 2NO7, 2NO9, 2NOA, 2QRN, 2QRO, 2ZI3, 2ZI4, 2ZI5, 2ZI6, 2ZI7, 2ZI9, 2ZIA, 3HP1, 3IPX, 3IPY, 3KFX, 3MJR, 3QEJ, 3QEN, 3QEO, 4JLJ, 4JLK, 4JLM, 4JLN, 4KCG, 4L5B, 4Q18, 4Q19, 4Q1A, 4Q1B, 4Q1C, 4Q1D, 4Q1E, 4Q1F
Ідентифікатори
Символи	DCK, entrez:1633, deoxycytidine kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 125450 MGI: 102726 HomoloGene: 616 GeneCards: DCK
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • nucleoside kinase activity • deoxycytidine kinase activity • ATP binding • protein homodimerization activity • kinase activity • deoxynucleoside kinase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • pyrimidine nucleoside salvage • pyrimidine nucleotide metabolic process • purine-containing compound salvage • nucleobase-containing compound metabolic process • фосфорилювання • deoxyribonucleoside monophosphate biosynthetic process • nucleotide biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1633	13178
Ensembl	ENSG00000156136	ENSMUSG00000029366
UniProt	P27707	P43346
RefSeq (мРНК)	NM_000788	NM_007832
RefSeq (білок)	NP_000779	NP_031858
Локус (UCSC)	Хр. 4: 70.99 – 71.03 Mb	Хр. 5: 88.91 – 88.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATPPKRSCP		SFSASSEGTR		IKKISIEGNI		AAGKSTFVNI		LKQLCEDWEV
VPEPVARWCN		VQSTQDEFEE		LTMSQKNGGN		VLQMMYEKPE		RWSFTFQTYA
CLSRIRAQLA		SLNGKLKDAE		KPVLFFERSV		YSDRYIFASN		LYESECMNET
EWTIYQDWHD		WMNNQFGQSL		ELDGIIYLQA		TPETCLHRIY		LRGRNEEQGI
PLEYLEKLHY		KHESWLLHRT		LKTNFDYLQE		VPILTLDVNE		DFKDKYESLV
EKVKEFLSTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Eriksson S., Cederlund E., Bergman T., Joernvall H., Bohman C. (1991). Characterization of human deoxycytidine kinase. Correlation with cDNA sequences. FEBS Lett. 280: 363—366. PMID 2013338 DOI:10.1016/0014-5793(91)80332-W
• Johansson M., Brismar S., Karlsson A. (1997). Human deoxycytidine kinase is located in the cell nucleus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 11941—11945. PMID 9342341 DOI:10.1073/pnas.94.22.11941
• Sabini E., Ort S., Monnerjahn C., Konrad M., Lavie A. (2003). Structure of human dCK suggests strategies to improve anticancer and antiviral therapy. Nat. Struct. Biol. 10: 513—519. PMID 12808445 DOI:10.1038/nsb942
• Zhang Y., Secrist J.A. III, Ealick S.E. (2006). The structure of human deoxycytidine kinase in complex with clofarabine reveals key interactions for prodrug activation. Acta Crystallogr. D. 62: 133—139. PMID 16421443 DOI:10.1107/S0907444905034293
• Sabini E., Hazra S., Konrad M., Lavie A. (2007). Nonenantioselectivity property of human deoxycytidine kinase explained by structures of the enzyme in complex with L- and D-nucleosides. J. Med. Chem. 50: 3004—3014. PMID 17530837 DOI:10.1021/jm0700215

Див. також

• Хромосома 4