CTU1

CTU1 (англ. Cytosolic thiouridylase subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 348 амінокислот, а молекулярна маса — 36 450.

CTU1
Ідентифікатори
Символи	CTU1, ATPBD3, NCS6, cytosolic thiouridylase subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 612694 MGI: 2385277 HomoloGene: 102140 GeneCards: CTU1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • tRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleotidyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • cytosolic tRNA wobble base thiouridylase complex Біологічний процес • tRNA wobble uridine modification • tRNA thio-modification • tRNA processing • protein urmylation • tRNA wobble position uridine thiolation • tRNA modification Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	90353	233189
Ensembl	ENSG00000142544	ENSMUSG00000038888
UniProt	Q7Z7A3	Q99J10
RefSeq (мРНК)	NM_145232	NM_145582
RefSeq (білок)	NP_660275	NP_663557
Локус (UCSC)	Хр. 19: 51.1 – 51.11 Mb	Хр. 7: 43.32 – 43.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAPPCASCH		AARAALRRPL		SGQALCGACF		CAAFEAEVLH		TVLAGRLLPP
GAVVAVGASG		GKDSTVLAHV		LRALAPRLGI		SLQLVAVDEG		IGGYRDAALA
AVRRQAARWE		LPLTVVAYED		LFGGWTMDAV		ARSTAGSGRS		RSCCTFCGVL
RRRALEEGAR		RVGATHIVTG		HNADDMAETV		LMNFLRGDAG		RLARGGGLGS
PGEGGALPRC		RPLQFASQKE		VVLYAHFRRL		DYFSEECVYA		PEAFRGHARD
LLKRLEAARP		SAVLDLVHSA		ERLALAPAAR		PPRPGACSRC		GALASRALCQ
ACALLDGLNR		GRPRLAIGKG		RRGLDEEATP		GTPGDPARPP		ASKAVPTF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг тРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Schlieker C.D., Van der Veen A.G., Damon J.R., Spooner E., Ploegh H.L. (2008). A functional proteomics approach links the ubiquitin-related modifier Urm1 to a tRNA modification pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 18255—18260. PMID 19017811 DOI:10.1073/pnas.0808756105

Див. також

• Хромосома 19