CRMP1

CRMP1 (англ. Collapsin response mediator protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 572 амінокислот, а молекулярна маса — 62 184.

CRMP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4B3Z
Ідентифікатори
Символи	CRMP1, CRMP-1, DPYSL1, DRP-1, DRP1, ULIP-3, collapsin response mediator protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602462 MGI: 107793 HomoloGene: 20347 GeneCards: CRMP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds • filamin binding Клітинна компонента • веретено поділу • цитоскелет • центр організації мікротрубочок • цитоплазма • гіалоплазма • midbody • центросома • клітинне ядро Біологічний процес • neuron development • nucleobase-containing compound metabolic process • microtubule cytoskeleton organization • нейробіологія розвитку • axon guidance • negative regulation of actin filament binding • negative regulation of neuron projection development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1400	12933
Ensembl	ENSG00000072832	ENSMUSG00000029121
UniProt	Q14194	P97427
RefSeq (мРНК)	NM_001313 NM_001014809 NM_001288661 NM_001288662	NM_001136058 NM_007765
RefSeq (білок)	NP_001014809 NP_001275590 NP_001275591 NP_001304	NP_001129530 NP_031791
Локус (UCSC)	Хр. 4: 5.75 – 5.89 Mb	Хр. 5: 37.4 – 37.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSYQGKKSIP		HITSDRLLIK		GGRIINDDQS		LYADVYLEDG		LIKQIGENLI
VPGGVKTIEA		NGRMVIPGGI		DVNTYLQKPS		QGMTAADDFF		QGTRAALVGG
TTMIIDHVVP		EPGSSLLTSF		EKWHEAADTK		SCCDYSLHVD		ITSWYDGVRE
ELEVLVQDKG		VNSFQVYMAY		KDVYQMSDSQ		LYEAFTFLKG		LGAVILVHAE
NGDLIAQEQK		RILEMGITGP		EGHALSRPEE		LEAEAVFRAI		TIAGRINCPV
YITKVMSKSA		ADIIALARKK		GPLVFGEPIA		ASLGTDGTHY		WSKNWAKAAA
FVTSPPLSPD		PTTPDYLTSL		LACGDLQVTG		SGHCPYSTAQ		KAVGKDNFTL
IPEGVNGIEE		RMTVVWDKAV		ATGKMDENQF		VAVTSTNAAK		IFNLYPRKGR
IAVGSDADVV		IWDPDKLKTI		TAKSHKSAVE		YNIFEGMECH		GSPLVVISQG
KIVFEDGNIN		VNKGMGRFIP		RKAFPEHLYQ		RVKIRNKVFG		LQGVSRGMYD
GPVYEVPATP		KYATPAPSAK		SSPSKHQPPP		IRNLHQSNFS		LSGAQIDDNN
PRRTGHRIVA		PPGGRSNITS		LG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Torres R., Polymeropoulos M.H. (1998). Genomic organization and localization of the human CRMP-1 gene. DNA Res. 5: 393—395. PMID 10048489 DOI:10.1093/dnares/5.6.393
• Goshima Y., Nakamura F., Strittmatter P., Strittmatter S.M. (1995). Collapsin-induced growth cone collapse mediated by an intracellular protein related to UNC-33. Nature. 376: 509—514. PMID 7637782 DOI:10.1038/376509a0
• Wang L.H., Strittmatter S.M. (1997). Brain CRMP forms heterotetramers similar to liver dihydropyrimidinase. J. Neurochem. 69: 2261—2269. PMID 9375656

Див. також

• Хромосома 4