COPS4

COPS4 (англ. COP9 signalosome subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 46 269.

COPS4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4D0P, 4D10, 4D18, 4WSN
Ідентифікатори
Символи	COPS4, CSN4, COP9 signalosome subunit 4, SGN4
Зовнішні ІД	OMIM: 616008 MGI: 1349414 HomoloGene: 8067 GeneCards: COPS4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • NEDD8-specific protease activity Клітинна компонента • цитоплазма • COP9 signalosome • міжклітинні контакти • синапс • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • Синаптичні бульбашки • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • protein deneddylation • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51138	26891
Ensembl	ENSG00000138663	ENSMUSG00000035297
UniProt	Q9BT78	O88544
RefSeq (мРНК)	NM_001258006 NM_016129 NM_001330727	NM_012001 NM_001359203 NM_001359204
RefSeq (білок)	NP_001244935 NP_001317656 NP_057213	NP_036131 NP_001346132 NP_001346133
Локус (UCSC)	Хр. 4: 83.03 – 83.08 Mb	Хр. 5: 100.67 – 100.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAVRQDLA		QLMNSSGSHK		DLAGKYRQIL		EKAIQLSGAE		QLEALKAFVE
AMVNENVSLV		ISRQLLTDFC		THLPNLPDST		AKEIYHFTLE		KIQPRVISFE
EQVASIRQHL		ASIYEKEEDW		RNAAQVLVGI		PLETGQKQYN		VDYKLETYLK
IARLYLEDDD		PVQAEAYINR		ASLLQNESTN		EQLQIHYKVC		YARVLDYRRK
FIEAAQRYNE		LSYKTIVHES		ERLEALKHAL		HCTILASAGQ		QRSRMLATLF
KDERCQQLAA		YGILEKMYLD		RIIRGNQLQE		FAAMLMPHQK		ATTADGSSIL
DRAVIEHNLL		SASKLYNNIT		FEELGALLEI		PAAKAEKIAS		QMITEGRMNG
FIDQIDGIVH		FETREALPTW		DKQIQSLCFQ		VNNLLEKISQ		TAPEWTAQAM
EAQMAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Peyrl A., Weitzdoerfer R., Gulesserian T., Fountoulakis M., Lubec G. (2002). Aberrant expression of signaling-related proteins 14-3-3 gamma and RACK1 in fetal Down syndrome brain (trisomy 21), AND MASS SPECTROMETRY. Electrophoresis. 23: 152—157. PMID 11824616 DOI:10.1002/1522-2683(200201)23:1<152::AID-ELPS152>3.0.CO;2-T
• Granata A., Koo S.J., Haucke V., Schiavo G., Warner T.T. (2011). CSN complex controls the stability of selected synaptic proteins via a torsinA-dependent process. EMBO J. 30: 181—193. PMID 21102408 DOI:10.1038/emboj.2010.285

Див. також

• Хромосома 4