CNOT6L

CNOT6L (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 555 амінокислот, а молекулярна маса — 63 001.

CNOT6L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3NGN, 3NGO, 3NGQ, 5DV2
Ідентифікатори
Символи	CNOT6L, CCR4b, CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like
Зовнішні ІД	OMIM: 618069 MGI: 2443154 HomoloGene: 100830 GeneCards: CNOT6L
Онтологія гена Молекулярна функція • poly(A)-specific ribonuclease activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • 3'-5'-exoribonuclease activity Клітинна компонента • цитоплазма • CCR4-NOT complex • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • mRNA processing • transcription, DNA-templated • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • mRNA destabilization • positive regulation of cell population proliferation • Сайленсинг генів • regulation of translation • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	246175	231464
Ensembl	ENSG00000138767	ENSMUSG00000034724
UniProt	Q96LI5	Q8VEG6
RefSeq (мРНК)	NM_001286790 NM_144571 NM_001365006 NM_001365007	NM_001285511 NM_001285514 NM_144910 NM_178854
RefSeq (білок)	NP_001273719 NP_653172 NP_001351935 NP_001351936	NP_001272440 NP_001272443 NP_659159 NP_849185
Локус (UCSC)	Хр. 4: 77.71 – 77.82 Mb	Хр. 5: 96.22 – 96.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLIGMPKEK		YDPPDPRRIY		TIMSAEEVAN		GKKSHWAELE		ISGRVRSLST
SLWSLTHLTA		LHLNDNYLSR		IPPDIAKLHN		LVYLDLSSNK		LRSLPAELGN
MVSLRELLLN		NNLLRVLPYE		LGRLFQLQTL		GLKGNPLSQD		ILNLYQDPDG
TRKLLNFMLD		NLAVHPEQLP		PRPWITLKER		DQILPSASFT		VMCYNVLCDK
YATRQLYGYC		PSWALNWEYR		KKGIMEEIVN		CDADIISLQE		VETEQYFTLF
LPALKERGYD		GFFSPKSRAK		IMSEQERKHV		DGCAIFFKTE		KFTLVQKHTV
EFNQVAMANS		DGSEAMLNRV		MTKDNIGVAV		VLEVHKELFG		AGMKPIHAAD
KQLLIVANAH		MHWDPEYSDV		KLIQTMMFVS		EVKNILEKAS		SRPGSPTADP
NSIPLVLCAD		LNSLPDSGVV		EYLSNGGVAD		NHKDFKELRY		NECLMNFSCN
GKNGSSEGRI		THGFQLKSAY		ENNLMPYTNY		TFDFKGVIDY		IFYSKTHMNV
LGVLGPLDPQ		WLVENNITGC		PHPHIPSDHF		SLLTQLELHP		PLLPLVNGVH
LPNRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Mittal S., Aslam A., Doidge R., Medica R., Winkler G.S. (2011). The Ccr4a (CNOT6) and Ccr4b (CNOT6L) deadenylase subunits of the human Ccr4-Not complex contribute to the prevention of cell death and senescence. Mol. Biol. Cell. 22: 748—758. PMID 21233283 DOI:10.1091/mbc.E10-11-0898

Див. також

• Хромосома 4