CFD

CFD
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BIO, 1DFP, 1DIC, 1DST, 1DSU, 1FDP, 1HFD, 2XW9, 2XWA, 2XWB, 4CBN, 4CBO, 4D9R
Ідентифікатори
Символи	CFD, ADIPSIN, ADN, DF, PFD, complement factor D
Зовнішні ІД	OMIM: 134350 MGI: 87931 HomoloGene: 20453 GeneCards: CFD
Пов'язані генетичні захворювання
	recurrent Neisseria infections due to factor D deficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity; • serine-type peptidase activity; • serine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• extracellular region; • екзосома; • platelet alpha granule lumen; • secretory granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• complement activation; • platelet degranulation; • complement activation, alternative pathway; • протеоліз; • процес імунної системи; • вроджений імунітет; • neutrophil degranulation; • Сигнальний шлях Notch;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1675
	11537
	ENSG00000274619; ENSG00000197766
	ENSMUSG00000061780
	P00746
	P03953
	NM_001928; NM_001317335
	NM_001291915; NM_013459; NM_001329541
	NP_001304264; NP_001919
	NP_001278844; NP_001316470; NP_038487
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CFD (англ. Complement factor D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 253 амінокислот, а молекулярна маса — 27 033^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHSWERLAVL	VLLGAAACAA	PPRGRILGGR	EAEAHARPYM	ASVQLNGAHL
CGGVLVAEQW	VLSAAHCLED	AADGKVQVLL	GAHSLSQPEP	SKRLYDVLRA
VPHPDSQPDT	IDHDLLLLQL	SEKATLGPAV	RPLPWQRVDR	DVAPGTLCDV
AGWGIVNHAG	RRPDSLQHVL	LPVLDRATCN	RRTHHDGAIT	ERLMCAESNR
RDSCKGDSGG	PLVCGGVLEG	VVTSGSRVCG	NRKKPGIYTR	VASYAAWIDS
VLA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний шлях активації комплементу. Секретований назовні.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Niemann M.A., Bhown A.S., Bennett J.C., Volanakis J.E. (1984). Amino acid sequence of human D of the alternative complement pathway. Biochemistry. 23: 2482—2486. PMID 6383466 DOI:10.1021/bi00306a025
Johnson D.M.A., Gagnon J., Reid K.B.M. (1984). Amino acid sequence of human factor D of the complement system. Similarity in sequence between factor D and proteases of non-plasma origin. FEBS Lett. 166: 347—351. PMID 6363133 DOI:10.1016/0014-5793(84)80110-6
Volanakis J.E., Bhown A.S., Bennett J.C., Mole J.E. (1980). Partial amino acid sequence of human factor D: homology with serine proteases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 77: 1116—1119. PMID 6987665 DOI:10.1073/pnas.77.2.1116
Davis A.E. III (1980). Active site amino acid sequence of human factor D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 77: 4938—4942. PMID 6776531 DOI:10.1073/pnas.77.8.4938
Johnson D.M.A., Gagnon J., Reid K.B.M. (1980). Factor D of the alternative pathway of human complement. Purification, alignment and N-terminal amino acid sequences of the major cyanogen bromide fragments, and localization of the serine residue at the active site. Biochem. J. 187: 863—874. PMID 6821372 DOI:10.1042/bj1870863