CDY1

CDY1 (англ. Chromodomain Y-linked 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 60 473.

CDY1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FBM
Ідентифікатори
Символи	CDY1, CDY, CDY1A, chromodomain protein, Y-linked, 1, chromodomain Y-linked 1
Зовнішні ІД	OMIM: 400016 HomoloGene: 36165 GeneCards: CDY1
Онтологія гена Молекулярна функція • histone acetyltransferase activity • methylated histone binding • transferase activity • acyltransferase activity • каталітична активність • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • histone acetylation • обмін речовин • Сперматогенез • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9085	н/д
Ensembl	ENSG00000172288	н/д
UniProt	Q9Y6F8	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_004680 NM_170723	н/д
RefSeq (білок)	NP_004671 NP_733841	н/д
Локус (UCSC)	Хр. Y: 25.62 – 25.62 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASQEFEVEA		IVDKRQDKNG		NTQYLVRWKG		YDKQDDTWEP		EQHLMNCEKC
VHDFNRRQTE		KQKKLTWTTT		SRIFSNNARR		RTSRSTKANY		SKNSPKTPVT
DKHHRSKNRK		LFAASKNVRR		KAASILSDTK		NMEIINSTIE		TLAPDSPFDH
KTVSGFQKLE		KLDPIAADQQ		DTVVFKVTEG		KLLRDPLSRP		GAEQTGIQNK
TQIHPLMSQM		SGSVTASMAT		GSATRKGIVV		LIDPLAANGT		TDMHTSVPRV
KGGQRNITDD		SRDQPFIKKM		HFTIRLTESA		STYRDIVVKK		EDGFTQIVLS
TRSTEKNALN		TEVIKEIVNA		LNSAAADDSK		LVLFSAAGSV		FCCGLDFGYF
VKHLRNNRNT		ASLEMVDTIK		NFVNTFIQFK		KPIVVSVNGP		AIGLGASILP
LCDLVWANEK		AWFQTPYTTF		GQSPDGCSSI		TFPKMMGKAS		ANEMLIAGRK
LTAREACAKG		LVSQVFLTGT		FTQEVMIQIK		ELASYNPIVL		EECKALVRCN
IKLELEQANE		RECEVLRKIW		SSAQGIESML		KYVENKIDEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Lahn B.T., Page D.C. (1997). Functional coherence of the human Y chromosome. Science. 278: 675—680. PMID 9381176 DOI:10.1126/science.278.5338.675
• Lahn B.T., Page D.C. (1999). Retroposition of autosomal mRNA yielded testis-specific gene family on human Y chromosome. Nat. Genet. 21: 429—433. PMID 10192397 DOI:10.1038/7771
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fischle W., Franz H., Jacobs S.A., Allis C.D., Khorasanizadeh S. (2008). Specificity of the chromodomain Y chromosome family of chromodomains for lysine-methylated ARK(S/T) motifs. J. Biol. Chem. 283: 19626—19635. PMID 18450745 DOI:10.1074/jbc.M802655200
• Wu H., Min J., Antoshenko T., Plotnikov A.N. (2009). Crystal structures of human CDY proteins reveal a crotonase-like fold. Proteins. 76: 1054—1061. PMID 19507244 DOI:10.1002/prot.22472

Див. також

• Хромосома Y