CDKN2AIP

CDKN2AIP (англ. CDKN2A interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 61 125.

CDKN2AIP
Ідентифікатори
Символи	CDKN2AIP, CARF, CDKN2A interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 615914 MGI: 1918175 HomoloGene: 9752 GeneCards: CDKN2AIP
Онтологія гена Молекулярна функція • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • granular component Біологічний процес • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of signal transduction • positive regulation of cell growth • regulation of protein stability • negative regulation of cell growth Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55602	70925
Ensembl	ENSG00000168564	ENSMUSG00000038069
UniProt	Q9NXV6	Q8BI72
RefSeq (мРНК)	NM_017632 NM_001317343	NM_172407 NM_001359133
RefSeq (білок)	NP_001304272 NP_060102	NP_765995 NP_001346062
Локус (UCSC)	Хр. 4: 183.44 – 183.45 Mb	Хр. 8: 48.16 – 48.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQEVSEYLS		QNPRVAAWVE		ALRCDGETDK		HWRHRRDFLL		RNAGDLAPAG
GAASASTDEA		ADAESGTRNR		QLQQLISFSM		AWANHVFLGC		RYPQKVMDKI
LSMAEGIKVT		DAPTYTTRDE		LVAKVKKRGI		SSSNEGVEEP		SKKRVIEGKN
SSAVEQDHAK		TSAKTERASA		QQENSSTCIG		SAIKSESGNS		ARSSGISSQN
SSTSDGDRSV		SSQSSSSVSS		QVTTAGSGKA		SEAEAPDKHG		SASFVSLLKS
SVNSHMTQST		DSRQQSGSPK		KSALEGSSAS		ASQSSSEIEV		PLLGSSGSSE
VELPLLSSKP		SSETASSGLT		SKTSSEASVS		SSVAKNSSSS		GTSLLTPKSS
SSTNTSLLTS		KSTSQVAASL		LASKSSSQTS		GSLVSKSTSL		ASVSQLASKS
SSQTSTSQLP		SKSTSQSSES		SVKFSCKLTN		EDVKQKQPFF		NRLYKTVAWK
LVAVGGFSPN		VNHGELLNAA		IEALKATLDV		FFVPLKELAD		LPQNKSSQES
IVCELRCKSV		YLGTGCGKSK		ENAKAVASRE		ALKLFLKKKV		VVKICKRKYR
GSEIEDLVLL		DEESRPVNLP		PALKHPQELL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Kamrul H.M., Wadhwa R., Kaul S.C. (2007). CARF binds to three members (ARF, p53, and HDM2) of the p53 tumor-suppressor pathway. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1100: 312—315. PMID 17460193 DOI:10.1196/annals.1395.033
• Cheung C.T., Singh R., Kalra R.S., Kaul S.C., Wadhwa R. (2014). Collaborator of ARF (CARF) regulates proliferative fate of human cells by dose-dependent regulation of DNA damage signaling. J. Biol. Chem. 289: 18258—18269. PMID 24825908 DOI:10.1074/jbc.M114.547208
• Miki T.S., Richter H., Rueegger S., Grosshans H. (2014). PAXT-1 promotes XRN2 activity by stabilizing it through a conserved domain. Mol. Cell. 53: 351—360. PMID 24462208 DOI:10.1016/j.molcel.2014.01.001
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 4