CDK13

CDK13 (англ. Cyclin dependent kinase 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 512 амінокислот, а молекулярна маса — 164 923.

CDK13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5EFQ
Ідентифікатори
Символи	CDK13, CDC2L, CDC2L5, CHED, hcyclin-dependent kinase 13, cyclin dependent kinase 13, CHDFIDD
Зовнішні ІД	OMIM: 603309 MGI: 1916812 HomoloGene: 135707 GeneCards: CDK13
Пов'язані генетичні захворювання
Congenital heart defects, dysmorphic facial features, and intellectual developmental disorder, syndromic intellectual disability
Реагує на сполуку
at-7519, AZD5438
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • ATP binding • cyclin binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • transcription factor binding • protein kinase binding • RNA binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • nuclear speck • nuclear cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex • cyclin K-CDK13 complex • клітинне ядро • extracellular region • міжклітинний простір • Нуклеоплазма • хромосома • гіалоплазма • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • ficolin-1-rich granule lumen • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex Біологічний процес • кровотворення • phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • фосфорилювання • mRNA processing • multicellular organism development • protein phosphorylation • Сплайсинг РНК • positive regulation of cell population proliferation • GO:0022415 viral process • Альтернативний сплайсинг • regulation of mitotic nuclear division • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • neutrophil degranulation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of stem cell differentiation • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8621	69562
Ensembl	ENSG00000065883	ENSMUSG00000041297
UniProt	Q14004	Q69ZA1
RefSeq (мРНК)	NM_003718 NM_031267	NM_001081058 NM_027118
RefSeq (білок)	NP_003709 NP_112557	NP_001074527 NP_081394
Локус (UCSC)	Хр. 7: 39.95 – 40.1 Mb	Хр. 13: 17.88 – 17.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSSSDTALG		GGGGLSWAEK		KLEERRKRRR		FLSPQQPPLL		LPLLQPQLLQ
PPPPPPPLLF		LAAPGTAAAA		AAAAAASSSC		FSPGPPLEVK		RLARGKRRAG
GRQKRRRGPR		AGQEAEKRRV		FSLPQPQQDG		GGGASSGGGV		TPLVEYEDVS
SQSEQGLLLG		GASAATAATA		AGGTGGSGGS		PASSSGTQRR		GEGSERRPRR
DRRSSSGRSK		ERHREHRRRD		GQRGGSEASK		SRSRHSHSGE		ERAEVAKSGS
SSSSGGRRKS		ASATSSSSSS		RKDRDSKAHR		SRTKSSKEPP		SAYKEPPKAY
REDKTEPKAY		RRRRSLSPLG		GRDDSPVSHR		ASQSLRSRKS		PSPAGGGSSP
YSRRLPRSPS		PYSRRRSPSY		SRHSSYERGG		DVSPSPYSSS		SWRRSRSPYS
PVLRRSGKSR		SRSPYSSRHS		RSRSRHRLSR		SRSRHSSISP		STLTLKSSLA
AELNKNKKAR		AAEAARAAEA		AKAAEATKAA		EAAAKAAKAS		NTSTPTKGNT
ETSASASQTN		HVKDVKKIKI		EHAPSPSSGG		TLKNDKAKTK		PPLQVTKVEN
NLIVDKATKK		AVIVGKESKS		AATKEESVSL		KEKTKPLTPS		IGAKEKEQHV
ALVTSTLPPL		PLPPMLPEDK		EADSLRGNIS		VKAVKKEVEK		KLRCLLADLP
LPPELPGGDD		LSKSPEEKKT		ATQLHSKRRP		KICGPRYGET		KEKDIDWGKR
CVDKFDIIGI		IGEGTYGQVY		KARDKDTGEM		VALKKVRLDN		EKEGFPITAI
REIKILRQLT		HQSIINMKEI		VTDKEDALDF		KKDKGAFYLV		FEYMDHDLMG
LLESGLVHFN		ENHIKSFMRQ		LMEGLDYCHK		KNFLHRDIKC		SNILLNNRGQ
IKLADFGLAR		LYSSEESRPY		TNKVITLWYR		PPELLLGEER		YTPAIDVWSC
GCILGELFTK		KPIFQANQEL		AQLELISRIC		GSPCPAVWPD		VIKLPYFNTM
KPKKQYRRKL		REEFVFIPAA		ALDLFDYMLA		LDPSKRCTAE		QALQCEFLRD
VEPSKMPPPD		LPLWQDCHEL		WSKKRRRQKQ		MGMTDDVSTI		KAPRKDLSLG
LDDSRTNTPQ		GVLPSSQLKS		QGSSNVAPVK		TGPGQHLNHS		ELAILLNLLQ
SKTSVNMADF		VQVLNIKVNS		ETQQQLNKIN		LPAGILATGE		KQTDPSTPQQ
ESSKPLGGIQ		PSSQTIQPKV		ETDAAQAAVQ		SAFAVLLTQL		IKAQQSKQKD
VLLEERENGS		GHEASLQLRP		PPEPSTPVSG		QDDLIQHQDM		RILELTPEPD
RPRILPPDQR		PPEPPEPPPV		TEEDLDYRTE		NQHVPTTSSS		LTDPHAGVKA
ALLQLLAQHQ		PQDDPKREGG		IDYQAGDTYV		STSDYKDNFG		SSSFSSAPYV
SNDGLGSSSA		PPLERRSFIG		NSDIQSLDNY		STASSHSGGP		PQPSAFSESF
PSSVAGYGDI		YLNAGPMLFS		GDKDHRFEYS		HGPIAVLANS		SDPSTGPEST
HPLPAKMHNY		NYGGNLQENP		SGPSLMHGQT		WTSPAQGPGY		SQGYRGHIST
STGRGRGRGL		PY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85

Див. також

• Хромосома 7