CDC42BPB

CDC42BPB (англ. CDC42 binding protein kinase beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 711 амінокислот, а молекулярна маса — 194 315.

CDC42BPB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QFV, 3TKU, 4UAK, 4UAL
Ідентифікатори
Символи	CDC42BPB, MRCKB, CDC42 binding protein kinase beta, CHOCNS
Зовнішні ІД	OMIM: 614062 MGI: 2136459 HomoloGene: 55945 GeneCards: CDC42BPB
Пов'язані генетичні захворювання
diffuse large B-cell lymphoma
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • ATP binding • magnesium ion binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • cell-cell junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • cell leading edge • actomyosin • цитоскелет • екзосома • lamellipodium • cell projection Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • фосфорилювання • actomyosin structure organization • establishment or maintenance of cell polarity • protein phosphorylation • cytoskeleton organization • cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • actin cytoskeleton organization • actin cytoskeleton reorganization • peptidyl-threonine phosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9578	217866
Ensembl	ENSG00000198752	ENSMUSG00000021279
UniProt	Q9Y5S2 Q86XZ8	Q7TT50
RefSeq (мРНК)	NM_006035	NM_183016
RefSeq (білок)	NP_006026 NP_006026.3	NP_898837
Локус (UCSC)	Хр. 14: 102.93 – 103.06 Mb	Хр. 12: 111.26 – 111.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAKVRLKKL		EQLLLDGPWR		NESALSVETL		LDVLVCLYTE		CSHSALRRDK
YVAEFLEWAK		PFTQLVKEMQ		LHREDFEIIK		VIGRGAFGEV		AVVKMKNTER
IYAMKILNKW		EMLKRAETAC		FREERDVLVN		GDCQWITALH		YAFQDENHLY
LVMDYYVGGD		LLTLLSKFED		KLPEDMARFY		IGEMVLAIDS		IHQLHYVHRD
IKPDNVLLDV		NGHIRLADFG		SCLKMNDDGT		VQSSVAVGTP		DYISPEILQA
MEDGMGKYGP		ECDWWSLGVC		MYEMLYGETP		FYAESLVETY		GKIMNHEERF
QFPSHVTDVS		EEAKDLIQRL		ICSRERRLGQ		NGIEDFKKHA		FFEGLNWENI
RNLEAPYIPD		VSSPSDTSNF		DVDDDVLRNT		EILPPGSHTG		FSGLHLPFIG
FTFTTESCFS		DRGSLKSIMQ		SNTLTKDEDV		QRDLEHSLQM		EAYERRIRRL
EQEKLELSRK		LQESTQTVQS		LHGSSRALSN		SNRDKEIKKL		NEEIERLKNK
IADSNRLERQ		LEDTVALRQE		REDSTQRLRG		LEKQHRVVRQ		EKEELHKQLV
EASERLKSQA		KELKDAHQQR		KLALQEFSEL		NERMAELRAQ		KQKVSRQLRD
KEEEMEVATQ		KVDAMRQEMR		RAEKLRKELE		AQLDDAVAEA		SKERKLREHS
ENFCKQMESE		LEALKVKQGG		RGAGATLEHQ		QEISKIKSEL		EKKVLFYEEE
LVRREASHVL		EVKNVKKEVH		DSESHQLALQ		KEILMLKDKL		EKSKRERHNE
MEEAVGTIKD		KYERERAMLF		DENKKLTAEN		EKLCSFVDKL		TAQNRQLEDE
LQDLAAKKES		VAHWEAQIAE		IIQWVSDEKD		ARGYLQALAS		KMTEELEALR
SSSLGSRTLD		PLWKVRRSQK		LDMSARLELQ		SALEAEIRAK		QLVQEELRKV
KDANLTLESK		LKDSEAKNRE		LLEEMEILKK		KMEEKFRADT		GLKLPDFQDS
IFEYFNTAPL		AHDLTFRTSS		ASEQETQAPK		PEASPSMSVA		ASEQQEDMAR
PPQRPSAVPL		PTTQALALAG		PKPKAHQFSI		KSFSSPTQCS		HCTSLMVGLI
RQGYACEVCS		FACHVSCKDG		APQVCPIPPE		QSKRPLGVDV		QRGIGTAYKG
HVKVPKPTGV		KKGWQRAYAV		VCDCKLFLYD		LPEGKSTQPG		VIASQVLDLR
DDEFSVSSVL		ASDVIHATRR		DIPCIFRVTA		SLLGAPSKTS		SLLILTENEN
EKRKWVGILE		GLQSILHKNR		LRNQVVHVPL		EAYDSSLPLI		KAILTAAIVD
ADRIAVGLEE		GLYVIEVTRD		VIVRAADCKK		VHQIELAPRE		KIVILLCGRN
HHVHLYPWSS		LDGAEGSFDI		KLPETKGCQL		MATATLKRNS		GTCLFVAVKR
LILCYEIQRT		KPFHRKFNEI		VAPGSVQCLA		VLRDRLCVGY		PSGFCLLSIQ
GDGQPLNLVN		PNDPSLAFLS		QQSFDALCAV		ELESEEYLLC		FSHMGLYVDP
QGRRARAQEL		MWPAAPVACS		CSPTHVTVYS		EYGVDVFDVR		TMEWVQTIGL
RRIRPLNSEG		TLNLLNCEPP		RLIYFKSKFS		GAVLNVPDTS		DNSKKQMLRT
RSKRRFVFKV		PEEERLQQRR		EMLRDPELRS		KMISNPTNFN		HVAHMGPGDG
MQVLMDLPLS		AVPPSQEERP		GPAPTNLARQ		PPSRNKPYIS		WPSSGGSEPS
VTVPLRSMSD		PDQDFDKEPD		SDSTKHSTPS		NSSNPSGPPS		PNSPHRSQLP
LEGLEQPACD		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Moncrieff C.L., Bailey M.E., Morrison N., Johnson K.J. (1999). Cloning and chromosomal localization of human Cdc42-binding protein kinase beta. Genomics. 57: 297—300. PMID 10198171 DOI:10.1006/geno.1999.5769
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tan I., Yong J., Dong J.M., Lim L., Leung T. (2008). A tripartite complex containing MRCK modulates lamellar actomyosin retrograde flow. Cell. 135: 123—136. PMID 18854160 DOI:10.1016/j.cell.2008.09.018
• Tan I., Lai J., Yong J., Li S.F., Leung T. (2011). Chelerythrine perturbs lamellar actomyosin filaments by selective inhibition of myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase. FEBS Lett. 585: 1260—1268. PMID 21457715 DOI:10.1016/j.febslet.2011.03.054

Див. також

• Хромосома 14