CD6

CD6 (англ. CD6 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 668 амінокислот, а молекулярна маса — 71 801.

CD6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A2E
Ідентифікатори
Символи	CD6, TP120, CD6 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 186720 MGI: 103566 HomoloGene: 4893 GeneCards: CD6
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз
Онтологія гена Молекулярна функція • lipopolysaccharide binding • lipoteichoic acid binding • scavenger receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • T cell receptor complex • extracellular region • immunological synapse • external side of plasma membrane Біологічний процес • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • acute inflammatory response to antigenic stimulus • рецептор-опосередкований ендоцитоз • response to lipopolysaccharide • адгезія клітин • positive regulation of T cell proliferation • вроджений імунітет • immunological synapse formation • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • vesicle-mediated transport • ендоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	923	12511
Ensembl	ENSG00000013725	ENSMUSG00000024670
UniProt	P30203	Q61003
RefSeq (мРНК)	NM_001254750 NM_001254751 NM_006725	NM_001037801 NM_009852
RefSeq (білок)	NP_001241679 NP_001241680 NP_006716	NP_001032890 NP_033982
Локус (UCSC)	Хр. 11: 60.97 – 61.02 Mb	Хр. 19: 10.77 – 10.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWLFFGITGL		LTAALSGHPS		PAPPDQLNTS		SAESELWEPG		ERLPVRLTNG
SSSCSGTVEV		RLEASWEPAC		GALWDSRAAE		AVCRALGCGG		AEAASQLAPP
TPELPPPPAA		GNTSVAANAT		LAGAPALLCS		GAEWRLCEVV		EHACRSDGRR
ARVTCAENRA		LRLVDGGGAC		AGRVEMLEHG		EWGSVCDDTW		DLEDAHVVCR
QLGCGWAVQA		LPGLHFTPGR		GPIHRDQVNC		SGAEAYLWDC		PGLPGQHYCG
HKEDAGAVCS		EHQSWRLTGG		ADRCEGQVEV		HFRGVWNTVC		DSEWYPSEAK
VLCQSLGCGT		AVERPKGLPH		SLSGRMYYSC		NGEELTLSNC		SWRFNNSNLC
SQSLAARVLC		SASRSLHNLS		TPEVPASVQT		VTIESSVTVK		IENKESRELM
LLIPSIVLGI		LLLGSLIFIA		FILLRIKGKY		ALPVMVNHQH		LPTTIPAGSN
SYQPVPITIP		KEVFMLPIQV		QAPPPEDSDS		GSDSDYEHYD		FSAQPPVALT
TFYNSQRHRV		TDEEVQQSRF		QMPPLEEGLE		ELHASHIPTA		NPGHCITDPP
SLGPQYHPRS		NSESSTSSGE		DYCNSPKSKL		PPWNPQVFSS		ERSSFLEQPP
NLELAGTQPA		FSAGPPADDS		SSTSSGEWYQ		NFQPPPQPPS		EEQFGCPGSP
SPQPDSTDND		DYDDISAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Aruffo A., Melnick M.B., Linsley P.S., Seed B. (1991). The lymphocyte glycoprotein CD6 contains a repeated domain structure characteristic of a new family of cell surface and secreted proteins. J. Exp. Med. 174: 949—952. PMID 1919444 DOI:10.1084/jem.174.4.949
• Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166. Eur. J. Immunol. 34: 930—940. PMID 15048703 DOI:10.1002/eji.200424856
• Swack J.A., Mier J.W., Romain P.L., Hull S.R., Rudd C.E. (1991). Biosynthesis and post-translational modification of CD6, a T cell signal-transducing molecule. J. Biol. Chem. 266: 7137—7143. PMID 2016320

Див. також

• Хромосома 11