CCDC88C

CCDC88C
Ідентифікатори
Символи	CCDC88C, DAPLE, HKRP2, KIAA1509, SCA40, coiled-coil domain containing 88C, HYC1
Зовнішні ІД	OMIM: 611204 MGI: 1915589 HomoloGene: 18903 GeneCards: CCDC88C
Пов'язані генетичні захворювання
	рак молочної залози, spinocerebellar ataxia type 40
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein self-association; • PDZ domain binding; • microtubule binding; • dynein light intermediate chain binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • центросома;
Біологічний процес	• regulation of protein phosphorylation; • stress-activated protein kinase signaling cascade; • protein homooligomerization; • Wnt signaling pathway; • protein destabilization; • cytoskeleton-dependent intracellular transport; • cytoplasmic microtubule organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	440193
	68339
	ENSG00000015133
	ENSMUSG00000021182
	Q9P219
	Q6VGS5
	NM_001080414
	NM_026681; NM_001362342
	NP_001073883
	NP_080957; NP_001349271
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CCDC88C (англ. Coiled-coil domain containing 88C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 028 амінокислот, а молекулярна маса — 228 230^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVTVSELLE	LFLQSPLVTW	VKTFGPFGSG	SQDNLTMYMD	LVDGIFLNQI
MLQIDPRPTN	QRINKHVNND	VNLRIQNLTI	LVRNIKTYYQ	EVLQQLIVMN
LPNVLMIGRD	PLSGKSMEEI	KKVLLLVLGC	AVQCERKEEF	IERIKQLDIE
TQAGIVAHIQ	EVTHNQENVF	DLQWLELPDV	APEELEALSR	SMVLHLRRLI
DQRDECTELI	VDLTQERDYL	QAQHPPSPIK	SSSADSTPSP	TSSLSSEDKQ
HLAVELADTK	ARLRRVRQEL	EDKTEQLVDT	RHEVDQLVLE	LQKVKQENIQ
LAADARSARA	YRDELDSLRE	KANRVERLEL	ELTRCKEKLH	DVDFYKARME
ELREDNIILI	ETKAMLEEQL	TAARARGDKV	HELEKENLQL	KSKLHDLELD
RDTDKKRIEE	LLEENMVLEI	AQKQSMNESA	HLGWELEQLS	KNADLSDASR
KSFVFELNEC	ASSRILKLEK	ENQSLQSTIQ	GLRDASLVLE	ESGLKCGELE
KENHQLSKKI	EKLQTQLERE	KQSNQDLETL	SEELIREKEQ	LQSDMETLKA
DKARQIKDLE	QEKDHLNRAM	WSLRERSQVS	SEARMKDVEK	ENKALHQTVT
EANGKLSQLE	FEKRQLHRDL	EQAKEKGERA	EKLERELQRL	QEENGRLARK
VTSLETATEK	VEALEHESQG	LQLENRTLRK	SLDTLQNVSL	QLEGLERDNK
QLDAENLELR	RLVETMRFTS	TKLAQMEREN	QQLEREKEEL	RKNVDLLKAL
GKKSERLELS	YQSVSAENLR	LQQSLESSSH	KTQTLESELG	ELEAERQALR
RDLEALRLAN	AQLEGAEKDR	KALEQEVAQL	EKDKKLLEKE	AKRLWQQVEL
KDAVLDDSTA	KLSAVEKESR	ALDKELARCR	DAAGKLKELE	KDNRDLTKQV
TVHARTLTTL	REDLVLEKLK	SQQLSSELDK	LSQELEKVGL	NRELLLQEDD
SGSDTKYKIL	EGRNESALKT	TLAMKEEKIV	LLEAQMEEKA	SLNRQLESEL
QMLKKECETL	RQNQGEGQHL	QNSFKHPAGK	TAASHQGKEA	WGPGHKEATM
ELLRVKDRAI	ELERNNAALQ	AEKQLLKEQL	QHLETQNVTF	SSQILTLQKQ
SAFLQEHNTT	LQTQTAKLQV	ENSTLSSQSA	ALTAQYTLLQ	NHHTAKETEN
ESLQRQQEQL	TAAYEALLQD	HEHLGTLHER	QSAEYEALIR	QHSCLKTLHR
NLELEHKELG	ERHGDMLKRK	AELEEREKVL	TTEREALQQE	QRTNALAMGE
NQRLRGELDR	VNFLHHQLKG	EYEELHAHTK	ELKTSLNNAQ	LELNRWQARF
DELKEQHQTM	DISLTKLDNH	CELLSRLKGN	LEEENHHLLS	QIQLLSQQNQ
MLLEQNMENK	EQYHEEQKQY	IDKLNALRRH	KEKLEEKIMD	QYKFYDPPPK
KKNHWIGAKA	LVKLIKPKKE	GSRERLKSTV	DSPPWQLESS	DPASPAASQP
LRSQAENPDT	PALGSNCAEE	RDAHNGSVGK	GPGDLKPKRG	SPHRGSLDRT
DASTDLAMRS	WPSELGSRTC	STSATTTAPS	NSTPIARHPG	RTKGYNSDDN
LCEPSLEFEV	PNHRQYVSRP	SSLESSRNTS	SNSSPLNLKG	SSEQLHGRSE
SFSSEDLIPS	RDLATLPREA	STPGRNALGR	HEYPLPRNGP	LPQEGAQKRG
TAPPYVGVRP	CSASPSSEMV	TLEEFLEESN	RSSPTHDTPS	CRDDLLSDYF
RKASDPPAIG	GQPGPPAKKE	GAKMPTNFVA	PTVKMAAPTS	EGRPLKPGQY
VKPNFRLTEA	EAPPSVAPRQ	AQPPQSLSLG	RPRQAPVPPA	SHAPASRSAS
LSRAFSLASA	DLLRASGPEA	CKQESPQKLG	APEALGGRET	GSHTLQSPAP
PSSHSLARER	TPLVGKAGSS	CQGPGPRSRP	LDTRRFSLAP	PKEERLAPLH
QSATAPAIAT	AGAGAAAAGS	GSNSQLLHFS	PAAAPAARTK	PKAPPRSGEV
ATITPVRAGL	SLSEGDGVPG	QGCSEGLPAK	SPGRSPDLAP	HLGRALEDCS
RGSVSKSSPA	SPEPGGDPQT	VWYEYGCV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143