CAPZA1

CAPZA1 (англ. Capping actin protein of muscle Z-line alpha subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 286 амінокислот, а молекулярна маса — 32 923.

CAPZA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MQ1, 1MWN
Ідентифікатори
Символи	CAPZA1, CAPPA1, CAPZ, CAZ1, capping actin protein of muscle Z-line alpha subunit 1, capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601580 MGI: 106227 HomoloGene: 24376 GeneCards: CAPZA1
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • actin filament binding Клітинна компонента • F-actin capping protein complex • цитоплазма • extracellular region • гіалоплазма • WASH complex • екзосома • цитоскелет • actin cytoskeleton • actin cortical patch Біологічний процес • barbed-end actin filament capping • вроджений імунітет • зсідання крові • actin filament capping • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • interleukin-12-mediated signaling pathway • cell junction assembly • actin cytoskeleton organization • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	829	12340
Ensembl	ENSG00000116489	ENSMUSG00000070372
UniProt	P52907	P47753
RefSeq (мРНК)	NM_006135	NM_009797 NM_001355044
RefSeq (білок)	NP_006126	NP_033927 NP_001341973
Локус (UCSC)	Хр. 1: 112.62 – 112.67 Mb	Хр. 3: 104.73 – 104.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADFDDRVSD		EEKVRIAAKF		ITHAPPGEFN		EVFNDVRLLL		NNDNLLREGA
AHAFAQYNMD		QFTPVKIEGY		EDQVLITEHG		DLGNSRFLDP		RNKISFKFDH
LRKEASDPQP		EEADGGLKSW		RESCDSALRA		YVKDHYSNGF		CTVYAKTIDG
QQTIIACIES		HQFQPKNFWN		GRWRSEWKFT		ITPPTAQVVG		VLKIQVHYYE
DGNVQLVSHK		DVQDSLTVSN		EAQTAKEFIK		IIENAENEYQ		TAISENYQTM
SDTTFKALRR		QLPVTRTKID		WNKILSYKIG		KEMQNA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до кепінгів актину. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Hart M.C., Korshunova Y.O., Cooper J.A. (1997). Vertebrates have conserved capping protein alpha isoforms with specific expression patterns. Cell Motil. Cytoskeleton. 38: 120—132. PMID 9331217 DOI:10.1002/(SICI)1097-0169(1997)38:2<120::AID-CM2>3.0.CO;2-B
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McClintock K.A., Shaw G.S. (2003). A novel S100 target conformation is revealed by the solution structure of the Ca2+-S100B-TRTK-12 complex. J. Biol. Chem. 278: 6251—6257. PMID 12480931 DOI:10.1074/jbc.M210622200

Див. також

• Хромосома 1