CA5A

CA5A (англ. Carbonic anhydrase 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 305 амінокислот, а молекулярна маса — 34 750.

CA5A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DMX, 1DMY, 1KEQ, 1URT
Ідентифікатори
Символи	CA5A, CA5, CA5AD, CAV, CAVA, GS1-21A4.1, carbonic anhydrase 5A
Зовнішні ІД	OMIM: 114761 MGI: 101946 HomoloGene: 68200 GeneCards: CA5A
Пов'язані генетичні захворювання
Hyperammonemic encephalopathy due to carbonic anhydrase VA deficiency
Реагує на сполуку
sulthiame, ethoxzolamide
Онтологія гена Молекулярна функція • carbonate dehydratase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • lyase activity • карбоангідрази Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • мітохондрія Біологічний процес • bicarbonate transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	763	12352
Ensembl	ENSG00000174990	ENSMUSG00000025317
UniProt	P35218	P23589
RefSeq (мРНК)	NM_001739 NM_001367225	NM_007608
RefSeq (білок)	NP_001730	NP_031634
Локус (UCSC)	Хр. 16: 87.88 – 87.94 Mb	Хр. 8: 122.64 – 122.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGRNTWKTS		AFSFLVEQMW		APLWSRSMRP		GRWCSQRSCA		WQTSNNTLHP
LWTVPVSVPG		GTRQSPINIQ		WRDSVYDPQL		KPLRVSYEAA		SCLYIWNTGY
LFQVEFDDAT		EASGISGGPL		ENHYRLKQFH		FHWGAVNEGG		SEHTVDGHAY
PAELHLVHWN		SVKYQNYKEA		VVGENGLAVI		GVFLKLGAHH		QTLQRLVDIL
PEIKHKDARA		AMRPFDPSTL		LPTCWDYWTY		AGSLTTPPLT		ESVTWIIQKE
PVEVAPSQLS		AFRTLLFSAL		GEEEKMMVNN		YRPLQPLMNR		KVWASFQATN
EGTRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ліаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Nagao Y., Platero J.S., Waheed A., Sly W.S. (1993). Human mitochondrial carbonic anhydrase: cDNA cloning, expression, subcellular localization, and mapping to chromosome 16. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 7623—7627. PMID 8356065 DOI:10.1073/pnas.90.16.7623
• Nagao Y., Batanian J.R., Clemente M.F., Sly W.S. (1995). Genomic organization of the human gene (CA5) and pseudogene for mitochondrial carbonic anhydrase V and their localization to chromosomes 16q and 16p. Genomics. 28: 477—484. PMID 7490083 DOI:10.1006/geno.1995.1177
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Temperini C., Scozzafava A., Vullo D., Supuran C.T. (2006). Carbonic anhydrase activators. Activation of isozymes I, II, IV, VA, VII, and XIV with l- and d-histidine and crystallographic analysis of their adducts with isoform II: engineering proton-transfer processes within the active site of an enzyme. Chemistry. 12: 7057—7066. PMID 16807956 DOI:10.1002/chem.200600159
• Temperini C., Scozzafava A., Vullo D., Supuran C.T. (2006). Carbonic anhydrase activators. Activation of isoforms I, II, IV, VA, VII, and XIV with L- and D-phenylalanine and crystallographic analysis of their adducts with isozyme II: stereospecific recognition within the active site of an enzyme and its consequences for the drug design. J. Med. Chem. 49: 3019—3027. PMID 16686544 DOI:10.1021/jm0603320
• Temperini C., Innocenti A., Scozzafava A., Mastrolorenzo A., Supuran C.T. (2007). Carbonic anhydrase activators: L-Adrenaline plugs the active site entrance of isozyme II, activating better isoforms I, IV, VA, VII, and XIV. Bioorg. Med. Chem. Lett. 17: 628—635. PMID 17127057 DOI:10.1016/j.bmcl.2006.11.027

Див. також

• Хромосома 16