C14orf166

C14orf166 (англ. Chromosome 14 open reading frame 166) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 244 амінокислот, а молекулярна маса — 28 068.

C14orf166
Ідентифікатори
Символи	RTRAF, CGI99, CLE, CLE7, LCRP369, RLLM1, CGI-99, C14orf166, hCLE1, chromosome 14 open reading frame 166, RNA transcription, translation and transport factor, hCLE
Зовнішні ІД	OMIM: 610858 MGI: 1915295 HomoloGene: 9355 GeneCards: RTRAF
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II complex binding • identical protein binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоскелет • гіалоплазма • клітинне ядро • tRNA-splicing ligase complex • цитоплазма • центр організації мікротрубочок • нуклеоплазма • центросома • perinuclear region of cytoplasm • mitotic spindle Біологічний процес • RNA transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0022415 viral process • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation • negative regulation of protein kinase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51637	68045
Ensembl	ENSG00000087302	ENSMUSG00000021807
UniProt	Q9Y224	Q9CQE8
RefSeq (мРНК)	NM_016039	NM_026528
RefSeq (білок)	NP_057123	NP_080804
Локус (UCSC)	Хр. 14: 51.99 – 52.01 Mb	Хр. 14: 19.86 – 19.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFRRKLTALD		YHNPAGFNCK		DETEFRNFIV		WLEDQKIRHY		KIEDRGNLRN
IHSSDWPKFF		EKYLRDVNCP		FKIQDRQEAI		DWLLGLAVRL		EYGDNAEKYK
DLVPDNSKTA		DNATKNAEPL		INLDVNNPDF		KAGVMALANL		LQIQRHDDYL
VMLKAIRILV		QERLTQDAVA		KANQTKEGLP		VALDKHILGF		DTGDAVLNEA
AQILRLLHIE		ELRELQTKIN		EAIVAVQAII		ADPKTDHRLG		KVGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Huarte M., Sanz-Ezquerro J.J., Roncal F., Ortin J., Nieto A. (2001). PA subunit from influenza virus polymerase complex interacts with a cellular protein with homology to a family of transcriptional activators. J. Virol. 75: 8597—8604. PMID 11507205 DOI:10.1128/JVI.75.18.8597-8604.2001
• Perez-Gonzalez A., Rodriguez A., Huarte M., Salanueva I.J., Nieto A. (2006). hCLE/CGI-99, a human protein that interacts with the influenza virus polymerase, is a mRNA transcription modulator. J. Mol. Biol. 362: 887—900. PMID 16950395 DOI:10.1016/j.jmb.2006.07.085
• Rodriguez A., Perez-Gonzalez A., Nieto A. (2011). Cellular human CLE/C14orf166 protein interacts with influenza virus polymerase and is required for viral replication. J. Virol. 85: 12062—12066. PMID 21900157 DOI:10.1128/JVI.00684-11
• Popow J., Jurkin J., Schleiffer A., Martinez J. (2014). Analysis of orthologous groups reveals archease and DDX1 as tRNA splicing factors. Nature. 511: 104—107. PMID 24870230 DOI:10.1038/nature13284

Див. також

• Хромосома 14