BDNF

BDNF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BND, 1B8M
Ідентифікатори
Символи	BDNF, brain-derived neurotrophic factor, ANON2, BULN2, Brain-derived neurotrophic factor, brain derived neurotrophic factor
Зовнішні ІД	OMIM: 113505 MGI: 88145 HomoloGene: 7245 GeneCards: BDNF
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding; • neurotrophin TRKB receptor binding; • growth factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • perinuclear region of cytoplasm; • мітохондрія; • nuclear speck; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • extracellular region; • міжклітинний простір; • Синаптичні бульбашки; • аксон; • дендрит (нейробіологія);
Біологічний процес	• brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway; • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • synapse assembly; • cell-cell signaling; • positive regulation of brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway; • collateral sprouting; • positive regulation of synapse assembly; • positive regulation of collateral sprouting; • нейробіологія розвитку; • axon guidance; • negative regulation of myotube differentiation; • positive regulation of receptor binding; • regulation of protein localization to cell surface; • regulation of signaling receptor activity; • activation of phospholipase C activity; • neurotrophin TRK receptor signaling pathway; • positive regulation of non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • peripheral nervous system development; • пам'ять; • nerve development; • nerve growth factor signaling pathway; • regulation of neuron differentiation; • neuron projection morphogenesis; • modulation of chemical synaptic transmission; • positive regulation of neuron projection development; • negative regulation of apoptotic signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	627
	12064
	ENSG00000176697
	ENSMUSG00000048482
	P23560
	P21237
NM_001143805; NM_001143806; NM_001143807; NM_001143808; NM_001143809;
	NM_001143810; NM_001143811; NM_001143812; NM_001143813; NM_001143814; NM_001143815; NM_001143816; NM_001709; NM_170731; NM_170732; NM_170733; NM_170734; NM_170735
NM_001048139; NM_001048141; NM_001048142; NM_007540; NM_001285416;
	NM_001285417; NM_001285418; NM_001285419; NM_001285420; NM_001285421; NM_001285422; NM_001316310
NP_001137277; NP_001137278; NP_001137279; NP_001137280; NP_001137281;
	NP_001137282; NP_001137283; NP_001137284; NP_001137285; NP_001137286; NP_001137288; NP_001700; NP_733927; NP_733928; NP_733929; NP_733930; NP_733931
NP_001041604; NP_001041606; NP_001041607; NP_001272345; NP_001272346;
	NP_001272347; NP_001272348; NP_001272349; NP_001272350; NP_001272351; NP_001303239; NP_031566
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BDNF (англ. Brain derived neurotrophic factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 247 амінокислот, а молекулярна маса — 27 818^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTILFLTMVI	SYFGCMKAAP	MKEANIRGQG	GLAYPGVRTH	GTLESVNGPK
AGSRGLTSLA	DTFEHVIEEL	LDEDQKVRPN	EENNKDADLY	TSRVMLSSQV
PLEPPLLFLL	EEYKNYLDAA	NMSMRVRRHS	DPARRGELSV	CDSISEWVTA
ADKKTAVDMS	GGTVTVLEKV	PVSKGQLKQY	FYETKCNPMG	YTKEGCRGID
KRHWNSQCRT	TQSYVRALTM	DSKKRIGWRF	IRIDTSCVCT	LTIKRGR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів росту. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література ред.

Jones K.R., Reichardt L.F. (1990). Molecular cloning of a human gene that is a member of the nerve growth factor family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 8060—8064. PMID 2236018 DOI:10.1073/pnas.87.20.8060
Shintani A., Ono Y., Kaisho Y., Igarashi K. (1992). Characterization of the 5'-flanking region of the human brain-derived neurotrophic factor gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 182: 325—332. PMID 1339267 DOI:10.1016/S0006-291X(05)80148-2
Pruunsild P., Kazantseva A., Aid T., Palm K., Timmusk T. (2007). Dissecting the human BDNF locus: bidirectional transcription, complex splicing, and multiple promoters. Genomics. 90: 397—406. PMID 17629449 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.05.004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hallboeoek F., Ibanez C.F., Persson H. (1991). Evolutionary studies of the nerve growth factor family reveal a novel member abundantly expressed in Xenopus ovary. Neuron. 6: 845—858. PMID 2025430 DOI:10.1016/0896-6273(91)90180-8
Robinson R.C., Radziejewski C., Stuart D.I., Jones E.Y. (1995). Structure of the brain-derived neurotrophic factor/neurotrophin 3 heterodimer. Biochemistry. 34: 4139—4146. PMID 7703225 DOI:10.1021/bi00013a001