BCL6

BCL6 (англ. B-cell CLL/lymphoma 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 706 амінокислот, а молекулярна маса — 78 846.

BCL6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1R28, 1R29, 1R2B, 2EN2, 2EOS, 2LCE, 2YRM, 3BIM, 3E4U, 3LBZ, 4CP3, 4U2M
Ідентифікатори
Символи	BCL6, BCL5, BCL6A, LAZ3, ZBTB27, ZNF51, B-cell CLL/lymphoma 6, B cell CLL/lymphoma 6, transcription repressor, BCL6 transcription repressor
Зовнішні ІД	OMIM: 109565 MGI: 107187 HomoloGene: 7640 GeneCards: BCL6
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • nucleic acid binding • chromatin DNA binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • replication fork • клітинне ядро • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі Біологічний процес • regulation of germinal center formation • positive regulation of histone deacetylation • negative regulation of T-helper 2 cell differentiation • GO:0034613 protein localization • negative regulation of mast cell cytokine production • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • процес імунної системи • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell differentiation • germinal center formation • negative regulation of Rho protein signal transduction • negative regulation of isotype switching to IgE isotypes • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • type 2 immune response • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of cell-matrix adhesion • regulation of cell population proliferation • positive regulation of B cell proliferation • negative regulation of cell growth • Rho protein signal transduction • GO:0000767 cell morphogenesis • Сперматогенез • regulation of memory T cell differentiation • positive regulation of neuron differentiation • regulation of inflammatory response • regulation of immune response • positive regulation of apoptotic process • negative regulation of type 2 immune response • negative regulation of B cell apoptotic process • B cell differentiation • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • actin cytoskeleton organization • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of Notch signaling pathway • erythrocyte development • negative regulation of cellular senescence • regulation of apoptotic process • negative regulation of mitotic cell cycle DNA replication • positive regulation of regulatory T cell differentiation • cytokine-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	604	12053
Ensembl	ENSG00000113916	ENSMUSG00000022508
UniProt	P41182	P41183
RefSeq (мРНК)	NM_001130845 NM_001134738 NM_001706 NM_138931	NM_009744 NM_001348026
RefSeq (білок)	NP_001124317 NP_001128210 NP_001697	NP_001334955 NP_033874
Локус (UCSC)	Хр. 3: 187.72 – 187.75 Mb	Хр. 16: 23.78 – 23.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASPADSCIQ		FTRHASDVLL		NLNRLRSRDI		LTDVVIVVSR		EQFRAHKTVL
MACSGLFYSI		FTDQLKCNLS		VINLDPEINP		EGFCILLDFM		YTSRLNLREG
NIMAVMATAM		YLQMEHVVDT		CRKFIKASEA		EMVSAIKPPR		EEFLNSRMLM
PQDIMAYRGR		EVVENNLPLR		SAPGCESRAF		APSLYSGLST		PPASYSMYSH
LPVSSLLFSD		EEFRDVRMPV		ANPFPKERAL		PCDSARPVPG		EYSRPTLEVS
PNVCHSNIYS		PKETIPEEAR		SDMHYSVAEG		LKPAAPSARN		APYFPCDKAS
KEEERPSSED		EIALHFEPPN		APLNRKGLVS		PQSPQKSDCQ		PNSPTESCSS
KNACILQASG		SPPAKSPTDP		KACNWKKYKF		IVLNSLNQNA		KPEGPEQAEL
GRLSPRAYTA		PPACQPPMEP		ENLDLQSPTK		LSASGEDSTI		PQASRLNNIV
NRSMTGSPRS		SSESHSPLYM		HPPKCTSCGS		QSPQHAEMCL		HTAGPTFPEE
MGETQSEYSD		SSCENGAFFC		NECDCRFSEE		ASLKRHTLQT		HSDKPYKCDR
CQASFRYKGN		LASHKTVHTG		EKPYRCNICG		AQFNRPANLK		THTRIHSGEK
PYKCETCGAR		FVQVAHLRAH		VLIHTGEKPY		PCEICGTRFR		HLQTLKSHLR
IHTGEKPYHC		EKCNLHFRHK		SQLRLHLRQK		HGAITNTKVQ		YRVSATDLPP
ELPKAC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Niu H., Ye B.H., Dalla-Favera R. (1998). Antigen receptor signaling induces MAP kinase-mediated phosphorylation and degradation of the BCL-6 transcription factor. Genes Dev. 12: 1953—1961. PMID 9649500 DOI:10.1101/gad.12.13.1953
• Bereshchenko O.R., Gu W., Dalla-Favera R. (2002). Acetylation inactivates the transcriptional repressor BCL6. Nat. Genet. 32: 606—613. PMID 12402037 DOI:10.1038/ng1018
• Mascle X., Albagli O., Lemercier C. (2003). Point mutations in BCL6 DNA-binding domain reveal distinct roles for the six zinc fingers. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 391—396. PMID 12504096 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02873-5
• Phan R.T., Dalla-Favera R. (2004). The BCL6 proto-oncogene suppresses p53 expression in germinal-centre B-cells. Nature. 432: 635—639. PMID 15577913 DOI:10.1038/nature03147
• Phan R.T., Saito M., Basso K., Niu H., Dalla-Favera R. (2005). BCL6 interacts with the transcription factor Miz-1 to suppress the cyclin-dependent kinase inhibitor p21 and cell cycle arrest in germinal center B cells. Nat. Immunol. 6: 1054—1060. PMID 16142238 DOI:10.1038/ni1245

Див. також

• Хромосома 3